Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf18Q7TS55 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf18Q7TS55 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf18Q7TS55 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf18Q7TS55 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf18Q7TS55 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf18Q7TS55 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf18Q7TS55 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf18Q7TS55 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnfsf18Q7TS55 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnfsf18Q7TS55 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnfsf18Q7TS55 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnfsf18Q7TS55 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf18Q7TS55 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf18Q7TS55 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf18Q7TS55 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf18Q7TS55 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf18Q7TS55 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf18Q7TS55 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf18Q7TS55 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf18Q7TS55 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf18Q7TS55 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf18Q7TS55 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf18Q7TS55 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf18Q7TS55 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf18Q7TS55 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf18Q7TS55 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf18Q7TS55 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf18Q7TS55 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf18Q7TS55 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf18Q7TS55 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf18Q7TS55 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf18Q7TS55 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf18Q7TS55 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf18Q7TS55 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf18Q7TS55 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf18Q7TS55 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf18Q7TS55 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf18Q7TS55 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf18Q7TS55 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tnfsf18Q7TS55 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfsf18Q7TS55 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfsf18Q7TS55 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfsf18Q7TS55 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfsf18Q7TS55 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfsf18Q7TS55 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfsf18Q7TS55 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfsf18Q7TS55 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tnfsf18Q7TS55 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tnfsf18Q7TS55 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tnfsf18Q7TS55 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfsf18Q7TS55 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfsf18Q7TS55 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfsf18Q7TS55 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfsf18Q7TS55 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfsf18Q7TS55 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfsf18Q7TS55 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfsf18Q7TS55 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfsf18Q7TS55 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfsf18Q7TS55 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfsf18Q7TS55 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tnfsf18Q7TS55 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Tnfsf18Q7TS55 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tnfsf18Q7TS55 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tnfsf18Q7TS55 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Tnfsf18Q7TS55 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Tnfsf18Q7TS55 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Tnfsf18Q7TS55 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tnfsf18Q7TS55 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tnfsf18Q7TS55 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tnfsf18Q7TS55 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tnfsf18Q7TS55 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tnfsf18Q7TS55 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tnfsf18Q7TS55 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Tnfsf18Q7TS55 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tnfsf18Q7TS55 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tnfsf18Q7TS55 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tnfsf18Q7TS55 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnfsf18Q7TS55 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnfsf18Q7TS55 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnfsf18Q7TS55 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnfsf18Q7TS55 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnfsf18Q7TS55 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnfsf18Q7TS55 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnfsf18Q7TS55 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnfsf18Q7TS55 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnfsf18Q7TS55 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnfsf18Q7TS55 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnfsf18Q7TS55 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnfsf18Q7TS55 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnfsf18Q7TS55 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnfsf18Q7TS55 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tnfsf18Q7TS55 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tnfsf18Q7TS55 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tnfsf18Q7TS55 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tnfsf18Q7TS55 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tnfsf18Q7TS55 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tnfsf18Q7TS55 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tnfsf18Q7TS55 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tnfsf18Q7TS55 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms