Protein–RNA interactions for Protein: Q78Y63

Pdcl2, Phosducin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl2Q78Y63 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdcl2Q78Y63 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdcl2Q78Y63 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdcl2Q78Y63 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdcl2Q78Y63 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdcl2Q78Y63 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pdcl2Q78Y63 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pdcl2Q78Y63 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pdcl2Q78Y63 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pdcl2Q78Y63 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pdcl2Q78Y63 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pdcl2Q78Y63 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Pdcl2Q78Y63 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pdcl2Q78Y63 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pdcl2Q78Y63 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pdcl2Q78Y63 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pdcl2Q78Y63 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pdcl2Q78Y63 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pdcl2Q78Y63 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pdcl2Q78Y63 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pdcl2Q78Y63 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Pdcl2Q78Y63 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pdcl2Q78Y63 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdcl2Q78Y63 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdcl2Q78Y63 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdcl2Q78Y63 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdcl2Q78Y63 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdcl2Q78Y63 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdcl2Q78Y63 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdcl2Q78Y63 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdcl2Q78Y63 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdcl2Q78Y63 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdcl2Q78Y63 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdcl2Q78Y63 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdcl2Q78Y63 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdcl2Q78Y63 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pdcl2Q78Y63 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pdcl2Q78Y63 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pdcl2Q78Y63 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pdcl2Q78Y63 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pdcl2Q78Y63 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdcl2Q78Y63 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdcl2Q78Y63 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdcl2Q78Y63 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdcl2Q78Y63 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdcl2Q78Y63 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdcl2Q78Y63 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdcl2Q78Y63 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdcl2Q78Y63 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdcl2Q78Y63 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdcl2Q78Y63 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdcl2Q78Y63 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdcl2Q78Y63 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdcl2Q78Y63 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdcl2Q78Y63 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdcl2Q78Y63 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdcl2Q78Y63 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdcl2Q78Y63 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdcl2Q78Y63 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdcl2Q78Y63 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdcl2Q78Y63 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdcl2Q78Y63 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdcl2Q78Y63 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdcl2Q78Y63 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pdcl2Q78Y63 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pdcl2Q78Y63 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pdcl2Q78Y63 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pdcl2Q78Y63 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pdcl2Q78Y63 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pdcl2Q78Y63 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pdcl2Q78Y63 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pdcl2Q78Y63 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdcl2Q78Y63 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdcl2Q78Y63 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdcl2Q78Y63 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdcl2Q78Y63 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdcl2Q78Y63 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdcl2Q78Y63 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdcl2Q78Y63 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdcl2Q78Y63 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdcl2Q78Y63 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdcl2Q78Y63 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdcl2Q78Y63 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdcl2Q78Y63 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdcl2Q78Y63 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdcl2Q78Y63 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdcl2Q78Y63 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdcl2Q78Y63 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdcl2Q78Y63 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdcl2Q78Y63 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdcl2Q78Y63 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdcl2Q78Y63 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pdcl2Q78Y63 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pdcl2Q78Y63 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pdcl2Q78Y63 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pdcl2Q78Y63 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pdcl2Q78Y63 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pdcl2Q78Y63 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pdcl2Q78Y63 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pdcl2Q78Y63 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms