Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQE4

Nemp1, Nuclear envelope integral membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nemp1Q6ZQE4 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Nemp1Q6ZQE4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nemp1Q6ZQE4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nemp1Q6ZQE4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Nemp1Q6ZQE4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nemp1Q6ZQE4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nemp1Q6ZQE4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Nemp1Q6ZQE4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nemp1Q6ZQE4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nemp1Q6ZQE4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Nemp1Q6ZQE4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Nemp1Q6ZQE4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nemp1Q6ZQE4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nemp1Q6ZQE4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nemp1Q6ZQE4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nemp1Q6ZQE4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nemp1Q6ZQE4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nemp1Q6ZQE4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nemp1Q6ZQE4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nemp1Q6ZQE4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nemp1Q6ZQE4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nemp1Q6ZQE4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nemp1Q6ZQE4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nemp1Q6ZQE4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nemp1Q6ZQE4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nemp1Q6ZQE4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nemp1Q6ZQE4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nemp1Q6ZQE4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nemp1Q6ZQE4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nemp1Q6ZQE4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nemp1Q6ZQE4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Nemp1Q6ZQE4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nemp1Q6ZQE4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nemp1Q6ZQE4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nemp1Q6ZQE4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nemp1Q6ZQE4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nemp1Q6ZQE4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nemp1Q6ZQE4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nemp1Q6ZQE4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nemp1Q6ZQE4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nemp1Q6ZQE4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nemp1Q6ZQE4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nemp1Q6ZQE4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nemp1Q6ZQE4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nemp1Q6ZQE4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nemp1Q6ZQE4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nemp1Q6ZQE4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nemp1Q6ZQE4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nemp1Q6ZQE4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nemp1Q6ZQE4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nemp1Q6ZQE4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nemp1Q6ZQE4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nemp1Q6ZQE4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nemp1Q6ZQE4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nemp1Q6ZQE4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nemp1Q6ZQE4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nemp1Q6ZQE4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nemp1Q6ZQE4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Nemp1Q6ZQE4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nemp1Q6ZQE4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nemp1Q6ZQE4 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nemp1Q6ZQE4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nemp1Q6ZQE4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nemp1Q6ZQE4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nemp1Q6ZQE4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nemp1Q6ZQE4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nemp1Q6ZQE4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nemp1Q6ZQE4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nemp1Q6ZQE4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nemp1Q6ZQE4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nemp1Q6ZQE4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Nemp1Q6ZQE4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nemp1Q6ZQE4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nemp1Q6ZQE4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nemp1Q6ZQE4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Nemp1Q6ZQE4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nemp1Q6ZQE4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nemp1Q6ZQE4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nemp1Q6ZQE4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nemp1Q6ZQE4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nemp1Q6ZQE4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nemp1Q6ZQE4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nemp1Q6ZQE4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nemp1Q6ZQE4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nemp1Q6ZQE4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Nemp1Q6ZQE4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nemp1Q6ZQE4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nemp1Q6ZQE4 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nemp1Q6ZQE4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nemp1Q6ZQE4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nemp1Q6ZQE4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nemp1Q6ZQE4 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Nemp1Q6ZQE4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nemp1Q6ZQE4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nemp1Q6ZQE4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nemp1Q6ZQE4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nemp1Q6ZQE4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Nemp1Q6ZQE4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nemp1Q6ZQE4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nemp1Q6ZQE4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms