Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ12

Ninl, Ninein-like protein, mousemouse

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Length 1,394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinlQ6ZQ12 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
NinlQ6ZQ12 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NinlQ6ZQ12 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NinlQ6ZQ12 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NinlQ6ZQ12 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NinlQ6ZQ12 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NinlQ6ZQ12 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NinlQ6ZQ12 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NinlQ6ZQ12 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NinlQ6ZQ12 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NinlQ6ZQ12 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
NinlQ6ZQ12 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NinlQ6ZQ12 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NinlQ6ZQ12 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NinlQ6ZQ12 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NinlQ6ZQ12 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NinlQ6ZQ12 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NinlQ6ZQ12 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NinlQ6ZQ12 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NinlQ6ZQ12 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
NinlQ6ZQ12 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NinlQ6ZQ12 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NinlQ6ZQ12 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NinlQ6ZQ12 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NinlQ6ZQ12 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NinlQ6ZQ12 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NinlQ6ZQ12 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
NinlQ6ZQ12 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NinlQ6ZQ12 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NinlQ6ZQ12 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NinlQ6ZQ12 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NinlQ6ZQ12 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NinlQ6ZQ12 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NinlQ6ZQ12 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NinlQ6ZQ12 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NinlQ6ZQ12 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NinlQ6ZQ12 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
NinlQ6ZQ12 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
NinlQ6ZQ12 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NinlQ6ZQ12 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NinlQ6ZQ12 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NinlQ6ZQ12 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NinlQ6ZQ12 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NinlQ6ZQ12 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NinlQ6ZQ12 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NinlQ6ZQ12 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NinlQ6ZQ12 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NinlQ6ZQ12 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NinlQ6ZQ12 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NinlQ6ZQ12 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NinlQ6ZQ12 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NinlQ6ZQ12 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NinlQ6ZQ12 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NinlQ6ZQ12 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NinlQ6ZQ12 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NinlQ6ZQ12 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NinlQ6ZQ12 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NinlQ6ZQ12 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NinlQ6ZQ12 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NinlQ6ZQ12 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NinlQ6ZQ12 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
NinlQ6ZQ12 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NinlQ6ZQ12 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NinlQ6ZQ12 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NinlQ6ZQ12 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NinlQ6ZQ12 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NinlQ6ZQ12 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NinlQ6ZQ12 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NinlQ6ZQ12 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
NinlQ6ZQ12 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NinlQ6ZQ12 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NinlQ6ZQ12 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NinlQ6ZQ12 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NinlQ6ZQ12 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NinlQ6ZQ12 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NinlQ6ZQ12 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NinlQ6ZQ12 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NinlQ6ZQ12 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NinlQ6ZQ12 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NinlQ6ZQ12 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NinlQ6ZQ12 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NinlQ6ZQ12 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NinlQ6ZQ12 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
NinlQ6ZQ12 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
NinlQ6ZQ12 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NinlQ6ZQ12 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
NinlQ6ZQ12 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
NinlQ6ZQ12 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NinlQ6ZQ12 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NinlQ6ZQ12 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NinlQ6ZQ12 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NinlQ6ZQ12 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NinlQ6ZQ12 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
NinlQ6ZQ12 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NinlQ6ZQ12 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NinlQ6ZQ12 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NinlQ6ZQ12 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NinlQ6ZQ12 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NinlQ6ZQ12 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NinlQ6ZQ12 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
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