Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ11

Chsy1, Chondroitin sulfate synthase 1, mousemouse

Predictions only

Length 800 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy1Q6ZQ11 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Chsy1Q6ZQ11 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Chsy1Q6ZQ11 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Chsy1Q6ZQ11 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Chsy1Q6ZQ11 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Chsy1Q6ZQ11 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Chsy1Q6ZQ11 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Chsy1Q6ZQ11 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Chsy1Q6ZQ11 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Chsy1Q6ZQ11 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Chsy1Q6ZQ11 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Chsy1Q6ZQ11 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Chsy1Q6ZQ11 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Chsy1Q6ZQ11 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Chsy1Q6ZQ11 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Chsy1Q6ZQ11 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Chsy1Q6ZQ11 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Chsy1Q6ZQ11 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Chsy1Q6ZQ11 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Chsy1Q6ZQ11 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Chsy1Q6ZQ11 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Chsy1Q6ZQ11 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Chsy1Q6ZQ11 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Chsy1Q6ZQ11 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Chsy1Q6ZQ11 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Chsy1Q6ZQ11 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Chsy1Q6ZQ11 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Chsy1Q6ZQ11 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Chsy1Q6ZQ11 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Chsy1Q6ZQ11 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Chsy1Q6ZQ11 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Chsy1Q6ZQ11 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Chsy1Q6ZQ11 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Chsy1Q6ZQ11 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Chsy1Q6ZQ11 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Chsy1Q6ZQ11 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Chsy1Q6ZQ11 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Chsy1Q6ZQ11 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Chsy1Q6ZQ11 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Chsy1Q6ZQ11 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Chsy1Q6ZQ11 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Chsy1Q6ZQ11 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Chsy1Q6ZQ11 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Chsy1Q6ZQ11 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Chsy1Q6ZQ11 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Chsy1Q6ZQ11 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Chsy1Q6ZQ11 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Chsy1Q6ZQ11 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Chsy1Q6ZQ11 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Chsy1Q6ZQ11 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Chsy1Q6ZQ11 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Chsy1Q6ZQ11 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Chsy1Q6ZQ11 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Chsy1Q6ZQ11 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Chsy1Q6ZQ11 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Chsy1Q6ZQ11 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Chsy1Q6ZQ11 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Chsy1Q6ZQ11 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Chsy1Q6ZQ11 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Chsy1Q6ZQ11 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Chsy1Q6ZQ11 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Chsy1Q6ZQ11 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Chsy1Q6ZQ11 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Chsy1Q6ZQ11 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Chsy1Q6ZQ11 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Chsy1Q6ZQ11 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Chsy1Q6ZQ11 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Chsy1Q6ZQ11 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Chsy1Q6ZQ11 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Chsy1Q6ZQ11 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Chsy1Q6ZQ11 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Chsy1Q6ZQ11 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Chsy1Q6ZQ11 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Chsy1Q6ZQ11 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Chsy1Q6ZQ11 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Chsy1Q6ZQ11 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Chsy1Q6ZQ11 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Chsy1Q6ZQ11 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Chsy1Q6ZQ11 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Chsy1Q6ZQ11 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Chsy1Q6ZQ11 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Chsy1Q6ZQ11 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Chsy1Q6ZQ11 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Chsy1Q6ZQ11 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Chsy1Q6ZQ11 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Chsy1Q6ZQ11 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Chsy1Q6ZQ11 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Chsy1Q6ZQ11 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Chsy1Q6ZQ11 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Chsy1Q6ZQ11 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Chsy1Q6ZQ11 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Chsy1Q6ZQ11 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Chsy1Q6ZQ11 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Chsy1Q6ZQ11 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Chsy1Q6ZQ11 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Chsy1Q6ZQ11 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Chsy1Q6ZQ11 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Chsy1Q6ZQ11 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Chsy1Q6ZQ11 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Chsy1Q6ZQ11 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms