Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR5

Smpd4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd4Q6ZPR5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smpd4Q6ZPR5 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smpd4Q6ZPR5 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smpd4Q6ZPR5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smpd4Q6ZPR5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smpd4Q6ZPR5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smpd4Q6ZPR5 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smpd4Q6ZPR5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smpd4Q6ZPR5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smpd4Q6ZPR5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smpd4Q6ZPR5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smpd4Q6ZPR5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smpd4Q6ZPR5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smpd4Q6ZPR5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smpd4Q6ZPR5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smpd4Q6ZPR5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smpd4Q6ZPR5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smpd4Q6ZPR5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smpd4Q6ZPR5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smpd4Q6ZPR5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smpd4Q6ZPR5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smpd4Q6ZPR5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smpd4Q6ZPR5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smpd4Q6ZPR5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smpd4Q6ZPR5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smpd4Q6ZPR5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smpd4Q6ZPR5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smpd4Q6ZPR5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smpd4Q6ZPR5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smpd4Q6ZPR5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smpd4Q6ZPR5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smpd4Q6ZPR5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smpd4Q6ZPR5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smpd4Q6ZPR5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smpd4Q6ZPR5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smpd4Q6ZPR5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smpd4Q6ZPR5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smpd4Q6ZPR5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smpd4Q6ZPR5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smpd4Q6ZPR5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smpd4Q6ZPR5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smpd4Q6ZPR5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smpd4Q6ZPR5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smpd4Q6ZPR5 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smpd4Q6ZPR5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smpd4Q6ZPR5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Smpd4Q6ZPR5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Smpd4Q6ZPR5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smpd4Q6ZPR5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smpd4Q6ZPR5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smpd4Q6ZPR5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smpd4Q6ZPR5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smpd4Q6ZPR5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smpd4Q6ZPR5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smpd4Q6ZPR5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smpd4Q6ZPR5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smpd4Q6ZPR5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smpd4Q6ZPR5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smpd4Q6ZPR5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smpd4Q6ZPR5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smpd4Q6ZPR5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smpd4Q6ZPR5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smpd4Q6ZPR5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smpd4Q6ZPR5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smpd4Q6ZPR5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smpd4Q6ZPR5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smpd4Q6ZPR5 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smpd4Q6ZPR5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smpd4Q6ZPR5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smpd4Q6ZPR5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Smpd4Q6ZPR5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Smpd4Q6ZPR5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smpd4Q6ZPR5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smpd4Q6ZPR5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smpd4Q6ZPR5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smpd4Q6ZPR5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smpd4Q6ZPR5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smpd4Q6ZPR5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smpd4Q6ZPR5 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smpd4Q6ZPR5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smpd4Q6ZPR5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smpd4Q6ZPR5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smpd4Q6ZPR5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Smpd4Q6ZPR5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smpd4Q6ZPR5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smpd4Q6ZPR5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smpd4Q6ZPR5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Smpd4Q6ZPR5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smpd4Q6ZPR5 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smpd4Q6ZPR5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smpd4Q6ZPR5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smpd4Q6ZPR5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smpd4Q6ZPR5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smpd4Q6ZPR5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smpd4Q6ZPR5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smpd4Q6ZPR5 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smpd4Q6ZPR5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smpd4Q6ZPR5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smpd4Q6ZPR5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smpd4Q6ZPR5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms