Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGF5

Bms1, BMS1 homolog, ribosome assembly protein (Yeast), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bms1Q6PGF5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Bms1Q6PGF5 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Bms1Q6PGF5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Bms1Q6PGF5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Bms1Q6PGF5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Bms1Q6PGF5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Bms1Q6PGF5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Bms1Q6PGF5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Bms1Q6PGF5 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Bms1Q6PGF5 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Bms1Q6PGF5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Bms1Q6PGF5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Bms1Q6PGF5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Bms1Q6PGF5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Bms1Q6PGF5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Bms1Q6PGF5 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Bms1Q6PGF5 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Bms1Q6PGF5 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Bms1Q6PGF5 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Bms1Q6PGF5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Bms1Q6PGF5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Bms1Q6PGF5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Bms1Q6PGF5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Bms1Q6PGF5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Bms1Q6PGF5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Bms1Q6PGF5 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Bms1Q6PGF5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Bms1Q6PGF5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Bms1Q6PGF5 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Bms1Q6PGF5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Bms1Q6PGF5 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Bms1Q6PGF5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Bms1Q6PGF5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Bms1Q6PGF5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Bms1Q6PGF5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Bms1Q6PGF5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Bms1Q6PGF5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Bms1Q6PGF5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Bms1Q6PGF5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Bms1Q6PGF5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Bms1Q6PGF5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Bms1Q6PGF5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Bms1Q6PGF5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Bms1Q6PGF5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Bms1Q6PGF5 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Bms1Q6PGF5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Bms1Q6PGF5 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Bms1Q6PGF5 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Bms1Q6PGF5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Bms1Q6PGF5 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Bms1Q6PGF5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Bms1Q6PGF5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Bms1Q6PGF5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Bms1Q6PGF5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Bms1Q6PGF5 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Bms1Q6PGF5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Bms1Q6PGF5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Bms1Q6PGF5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Bms1Q6PGF5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Bms1Q6PGF5 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Bms1Q6PGF5 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Bms1Q6PGF5 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Bms1Q6PGF5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Bms1Q6PGF5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Bms1Q6PGF5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Bms1Q6PGF5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Bms1Q6PGF5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Bms1Q6PGF5 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Bms1Q6PGF5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Bms1Q6PGF5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Bms1Q6PGF5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Bms1Q6PGF5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Bms1Q6PGF5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Bms1Q6PGF5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Bms1Q6PGF5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Bms1Q6PGF5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Bms1Q6PGF5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Bms1Q6PGF5 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Bms1Q6PGF5 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Bms1Q6PGF5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Bms1Q6PGF5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Bms1Q6PGF5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Bms1Q6PGF5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Bms1Q6PGF5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Bms1Q6PGF5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Bms1Q6PGF5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Bms1Q6PGF5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Bms1Q6PGF5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Bms1Q6PGF5 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Bms1Q6PGF5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Bms1Q6PGF5 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Bms1Q6PGF5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Bms1Q6PGF5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Bms1Q6PGF5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Bms1Q6PGF5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Bms1Q6PGF5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Bms1Q6PGF5 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Bms1Q6PGF5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Bms1Q6PGF5 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Bms1Q6PGF5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129 ms