Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE87

Cfap206, Cilia- and flagella-associated protein 206, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap206Q6PE87 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cfap206Q6PE87 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cfap206Q6PE87 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cfap206Q6PE87 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cfap206Q6PE87 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cfap206Q6PE87 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cfap206Q6PE87 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cfap206Q6PE87 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cfap206Q6PE87 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cfap206Q6PE87 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cfap206Q6PE87 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cfap206Q6PE87 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cfap206Q6PE87 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cfap206Q6PE87 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cfap206Q6PE87 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Cfap206Q6PE87 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cfap206Q6PE87 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cfap206Q6PE87 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cfap206Q6PE87 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Cfap206Q6PE87 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cfap206Q6PE87 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cfap206Q6PE87 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cfap206Q6PE87 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cfap206Q6PE87 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cfap206Q6PE87 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cfap206Q6PE87 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cfap206Q6PE87 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cfap206Q6PE87 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cfap206Q6PE87 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cfap206Q6PE87 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cfap206Q6PE87 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cfap206Q6PE87 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cfap206Q6PE87 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cfap206Q6PE87 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cfap206Q6PE87 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cfap206Q6PE87 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cfap206Q6PE87 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cfap206Q6PE87 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cfap206Q6PE87 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cfap206Q6PE87 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cfap206Q6PE87 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Cfap206Q6PE87 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cfap206Q6PE87 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cfap206Q6PE87 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cfap206Q6PE87 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cfap206Q6PE87 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cfap206Q6PE87 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cfap206Q6PE87 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cfap206Q6PE87 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cfap206Q6PE87 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cfap206Q6PE87 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cfap206Q6PE87 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cfap206Q6PE87 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cfap206Q6PE87 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cfap206Q6PE87 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cfap206Q6PE87 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cfap206Q6PE87 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cfap206Q6PE87 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cfap206Q6PE87 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cfap206Q6PE87 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cfap206Q6PE87 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cfap206Q6PE87 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Cfap206Q6PE87 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cfap206Q6PE87 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cfap206Q6PE87 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cfap206Q6PE87 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cfap206Q6PE87 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cfap206Q6PE87 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cfap206Q6PE87 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cfap206Q6PE87 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cfap206Q6PE87 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cfap206Q6PE87 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cfap206Q6PE87 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cfap206Q6PE87 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cfap206Q6PE87 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cfap206Q6PE87 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cfap206Q6PE87 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cfap206Q6PE87 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cfap206Q6PE87 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cfap206Q6PE87 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cfap206Q6PE87 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cfap206Q6PE87 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cfap206Q6PE87 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cfap206Q6PE87 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cfap206Q6PE87 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Cfap206Q6PE87 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cfap206Q6PE87 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cfap206Q6PE87 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cfap206Q6PE87 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cfap206Q6PE87 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cfap206Q6PE87 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cfap206Q6PE87 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cfap206Q6PE87 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cfap206Q6PE87 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cfap206Q6PE87 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cfap206Q6PE87 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cfap206Q6PE87 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cfap206Q6PE87 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cfap206Q6PE87 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cfap206Q6PE87 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms