Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDY0

Ccdc85b, Coiled-coil domain-containing protein 85B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85bQ6PDY0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc85bQ6PDY0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccdc85bQ6PDY0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccdc85bQ6PDY0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc85bQ6PDY0 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc85bQ6PDY0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc85bQ6PDY0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc85bQ6PDY0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc85bQ6PDY0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc85bQ6PDY0 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc85bQ6PDY0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc85bQ6PDY0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc85bQ6PDY0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc85bQ6PDY0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc85bQ6PDY0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc85bQ6PDY0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc85bQ6PDY0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc85bQ6PDY0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc85bQ6PDY0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc85bQ6PDY0 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc85bQ6PDY0 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc85bQ6PDY0 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc85bQ6PDY0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc85bQ6PDY0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc85bQ6PDY0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc85bQ6PDY0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc85bQ6PDY0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc85bQ6PDY0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc85bQ6PDY0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc85bQ6PDY0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc85bQ6PDY0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc85bQ6PDY0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc85bQ6PDY0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc85bQ6PDY0 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc85bQ6PDY0 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc85bQ6PDY0 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc85bQ6PDY0 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc85bQ6PDY0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc85bQ6PDY0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc85bQ6PDY0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc85bQ6PDY0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc85bQ6PDY0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc85bQ6PDY0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc85bQ6PDY0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc85bQ6PDY0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc85bQ6PDY0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc85bQ6PDY0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc85bQ6PDY0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc85bQ6PDY0 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc85bQ6PDY0 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc85bQ6PDY0 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc85bQ6PDY0 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc85bQ6PDY0 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc85bQ6PDY0 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc85bQ6PDY0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc85bQ6PDY0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc85bQ6PDY0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc85bQ6PDY0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc85bQ6PDY0 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc85bQ6PDY0 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc85bQ6PDY0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc85bQ6PDY0 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc85bQ6PDY0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc85bQ6PDY0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc85bQ6PDY0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc85bQ6PDY0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc85bQ6PDY0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc85bQ6PDY0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc85bQ6PDY0 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc85bQ6PDY0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc85bQ6PDY0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc85bQ6PDY0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc85bQ6PDY0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc85bQ6PDY0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc85bQ6PDY0 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc85bQ6PDY0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc85bQ6PDY0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc85bQ6PDY0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc85bQ6PDY0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc85bQ6PDY0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc85bQ6PDY0 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc85bQ6PDY0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc85bQ6PDY0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc85bQ6PDY0 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc85bQ6PDY0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc85bQ6PDY0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc85bQ6PDY0 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc85bQ6PDY0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc85bQ6PDY0 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc85bQ6PDY0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc85bQ6PDY0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc85bQ6PDY0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc85bQ6PDY0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc85bQ6PDY0 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc85bQ6PDY0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc85bQ6PDY0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc85bQ6PDY0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc85bQ6PDY0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc85bQ6PDY0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms