Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDC0

Rundc3b, RUN domain-containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc3bQ6PDC0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rundc3bQ6PDC0 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rundc3bQ6PDC0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rundc3bQ6PDC0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rundc3bQ6PDC0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rundc3bQ6PDC0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rundc3bQ6PDC0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rundc3bQ6PDC0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rundc3bQ6PDC0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rundc3bQ6PDC0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rundc3bQ6PDC0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rundc3bQ6PDC0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rundc3bQ6PDC0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rundc3bQ6PDC0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rundc3bQ6PDC0 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rundc3bQ6PDC0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rundc3bQ6PDC0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rundc3bQ6PDC0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rundc3bQ6PDC0 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rundc3bQ6PDC0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rundc3bQ6PDC0 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rundc3bQ6PDC0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rundc3bQ6PDC0 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rundc3bQ6PDC0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rundc3bQ6PDC0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rundc3bQ6PDC0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rundc3bQ6PDC0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rundc3bQ6PDC0 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rundc3bQ6PDC0 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rundc3bQ6PDC0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rundc3bQ6PDC0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rundc3bQ6PDC0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rundc3bQ6PDC0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rundc3bQ6PDC0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rundc3bQ6PDC0 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rundc3bQ6PDC0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rundc3bQ6PDC0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rundc3bQ6PDC0 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rundc3bQ6PDC0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rundc3bQ6PDC0 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rundc3bQ6PDC0 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rundc3bQ6PDC0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rundc3bQ6PDC0 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rundc3bQ6PDC0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rundc3bQ6PDC0 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rundc3bQ6PDC0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rundc3bQ6PDC0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rundc3bQ6PDC0 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rundc3bQ6PDC0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rundc3bQ6PDC0 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rundc3bQ6PDC0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rundc3bQ6PDC0 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rundc3bQ6PDC0 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rundc3bQ6PDC0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rundc3bQ6PDC0 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rundc3bQ6PDC0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rundc3bQ6PDC0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rundc3bQ6PDC0 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rundc3bQ6PDC0 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rundc3bQ6PDC0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rundc3bQ6PDC0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rundc3bQ6PDC0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rundc3bQ6PDC0 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rundc3bQ6PDC0 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rundc3bQ6PDC0 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rundc3bQ6PDC0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rundc3bQ6PDC0 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rundc3bQ6PDC0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rundc3bQ6PDC0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rundc3bQ6PDC0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rundc3bQ6PDC0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rundc3bQ6PDC0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rundc3bQ6PDC0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rundc3bQ6PDC0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rundc3bQ6PDC0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rundc3bQ6PDC0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rundc3bQ6PDC0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rundc3bQ6PDC0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rundc3bQ6PDC0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rundc3bQ6PDC0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rundc3bQ6PDC0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rundc3bQ6PDC0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rundc3bQ6PDC0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rundc3bQ6PDC0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rundc3bQ6PDC0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rundc3bQ6PDC0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rundc3bQ6PDC0 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rundc3bQ6PDC0 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rundc3bQ6PDC0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rundc3bQ6PDC0 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rundc3bQ6PDC0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rundc3bQ6PDC0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Rundc3bQ6PDC0 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rundc3bQ6PDC0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rundc3bQ6PDC0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rundc3bQ6PDC0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rundc3bQ6PDC0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rundc3bQ6PDC0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rundc3bQ6PDC0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rundc3bQ6PDC0 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms