Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD26

Pigs, GPI transamidase component PIG-S, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PigsQ6PD26 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PigsQ6PD26 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PigsQ6PD26 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PigsQ6PD26 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PigsQ6PD26 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PigsQ6PD26 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PigsQ6PD26 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PigsQ6PD26 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PigsQ6PD26 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PigsQ6PD26 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PigsQ6PD26 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PigsQ6PD26 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PigsQ6PD26 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PigsQ6PD26 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PigsQ6PD26 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PigsQ6PD26 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PigsQ6PD26 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PigsQ6PD26 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PigsQ6PD26 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PigsQ6PD26 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PigsQ6PD26 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PigsQ6PD26 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PigsQ6PD26 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PigsQ6PD26 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PigsQ6PD26 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PigsQ6PD26 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PigsQ6PD26 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PigsQ6PD26 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PigsQ6PD26 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PigsQ6PD26 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PigsQ6PD26 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PigsQ6PD26 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PigsQ6PD26 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PigsQ6PD26 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PigsQ6PD26 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PigsQ6PD26 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PigsQ6PD26 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PigsQ6PD26 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PigsQ6PD26 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PigsQ6PD26 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PigsQ6PD26 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PigsQ6PD26 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PigsQ6PD26 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PigsQ6PD26 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PigsQ6PD26 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PigsQ6PD26 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PigsQ6PD26 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PigsQ6PD26 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PigsQ6PD26 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PigsQ6PD26 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PigsQ6PD26 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PigsQ6PD26 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PigsQ6PD26 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PigsQ6PD26 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PigsQ6PD26 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PigsQ6PD26 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PigsQ6PD26 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PigsQ6PD26 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PigsQ6PD26 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PigsQ6PD26 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PigsQ6PD26 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PigsQ6PD26 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PigsQ6PD26 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PigsQ6PD26 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PigsQ6PD26 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PigsQ6PD26 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PigsQ6PD26 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PigsQ6PD26 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PigsQ6PD26 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PigsQ6PD26 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PigsQ6PD26 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PigsQ6PD26 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PigsQ6PD26 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PigsQ6PD26 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PigsQ6PD26 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PigsQ6PD26 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PigsQ6PD26 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PigsQ6PD26 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PigsQ6PD26 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PigsQ6PD26 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PigsQ6PD26 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PigsQ6PD26 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PigsQ6PD26 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PigsQ6PD26 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PigsQ6PD26 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PigsQ6PD26 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PigsQ6PD26 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PigsQ6PD26 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PigsQ6PD26 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PigsQ6PD26 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PigsQ6PD26 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PigsQ6PD26 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PigsQ6PD26 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PigsQ6PD26 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PigsQ6PD26 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PigsQ6PD26 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PigsQ6PD26 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PigsQ6PD26 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PigsQ6PD26 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PigsQ6PD26 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms