Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9Z1

Smarcd3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcd3Q6P9Z1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smarcd3Q6P9Z1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smarcd3Q6P9Z1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smarcd3Q6P9Z1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smarcd3Q6P9Z1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smarcd3Q6P9Z1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smarcd3Q6P9Z1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smarcd3Q6P9Z1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smarcd3Q6P9Z1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smarcd3Q6P9Z1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smarcd3Q6P9Z1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smarcd3Q6P9Z1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smarcd3Q6P9Z1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smarcd3Q6P9Z1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smarcd3Q6P9Z1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smarcd3Q6P9Z1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smarcd3Q6P9Z1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smarcd3Q6P9Z1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smarcd3Q6P9Z1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smarcd3Q6P9Z1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smarcd3Q6P9Z1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smarcd3Q6P9Z1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smarcd3Q6P9Z1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smarcd3Q6P9Z1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smarcd3Q6P9Z1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smarcd3Q6P9Z1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smarcd3Q6P9Z1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smarcd3Q6P9Z1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smarcd3Q6P9Z1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smarcd3Q6P9Z1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smarcd3Q6P9Z1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smarcd3Q6P9Z1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smarcd3Q6P9Z1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smarcd3Q6P9Z1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smarcd3Q6P9Z1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smarcd3Q6P9Z1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smarcd3Q6P9Z1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smarcd3Q6P9Z1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smarcd3Q6P9Z1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smarcd3Q6P9Z1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smarcd3Q6P9Z1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smarcd3Q6P9Z1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smarcd3Q6P9Z1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smarcd3Q6P9Z1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smarcd3Q6P9Z1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smarcd3Q6P9Z1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smarcd3Q6P9Z1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smarcd3Q6P9Z1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smarcd3Q6P9Z1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smarcd3Q6P9Z1 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smarcd3Q6P9Z1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smarcd3Q6P9Z1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smarcd3Q6P9Z1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smarcd3Q6P9Z1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Smarcd3Q6P9Z1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smarcd3Q6P9Z1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Smarcd3Q6P9Z1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Smarcd3Q6P9Z1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Smarcd3Q6P9Z1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Smarcd3Q6P9Z1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smarcd3Q6P9Z1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smarcd3Q6P9Z1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smarcd3Q6P9Z1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smarcd3Q6P9Z1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smarcd3Q6P9Z1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smarcd3Q6P9Z1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smarcd3Q6P9Z1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smarcd3Q6P9Z1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smarcd3Q6P9Z1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smarcd3Q6P9Z1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smarcd3Q6P9Z1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smarcd3Q6P9Z1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smarcd3Q6P9Z1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smarcd3Q6P9Z1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smarcd3Q6P9Z1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smarcd3Q6P9Z1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smarcd3Q6P9Z1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smarcd3Q6P9Z1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smarcd3Q6P9Z1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smarcd3Q6P9Z1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smarcd3Q6P9Z1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smarcd3Q6P9Z1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smarcd3Q6P9Z1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smarcd3Q6P9Z1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smarcd3Q6P9Z1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smarcd3Q6P9Z1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smarcd3Q6P9Z1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smarcd3Q6P9Z1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smarcd3Q6P9Z1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smarcd3Q6P9Z1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smarcd3Q6P9Z1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smarcd3Q6P9Z1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Smarcd3Q6P9Z1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smarcd3Q6P9Z1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smarcd3Q6P9Z1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smarcd3Q6P9Z1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smarcd3Q6P9Z1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smarcd3Q6P9Z1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smarcd3Q6P9Z1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smarcd3Q6P9Z1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms