Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZZ6

Tmcc1, Transmembrane and coiled-coil domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmcc1Q69ZZ6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmcc1Q69ZZ6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmcc1Q69ZZ6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmcc1Q69ZZ6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmcc1Q69ZZ6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmcc1Q69ZZ6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmcc1Q69ZZ6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmcc1Q69ZZ6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmcc1Q69ZZ6 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmcc1Q69ZZ6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmcc1Q69ZZ6 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmcc1Q69ZZ6 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmcc1Q69ZZ6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmcc1Q69ZZ6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmcc1Q69ZZ6 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmcc1Q69ZZ6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmcc1Q69ZZ6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmcc1Q69ZZ6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tmcc1Q69ZZ6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tmcc1Q69ZZ6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tmcc1Q69ZZ6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tmcc1Q69ZZ6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tmcc1Q69ZZ6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tmcc1Q69ZZ6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tmcc1Q69ZZ6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tmcc1Q69ZZ6 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tmcc1Q69ZZ6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tmcc1Q69ZZ6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tmcc1Q69ZZ6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tmcc1Q69ZZ6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tmcc1Q69ZZ6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tmcc1Q69ZZ6 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tmcc1Q69ZZ6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tmcc1Q69ZZ6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tmcc1Q69ZZ6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tmcc1Q69ZZ6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tmcc1Q69ZZ6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tmcc1Q69ZZ6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tmcc1Q69ZZ6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tmcc1Q69ZZ6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tmcc1Q69ZZ6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tmcc1Q69ZZ6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tmcc1Q69ZZ6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tmcc1Q69ZZ6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tmcc1Q69ZZ6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tmcc1Q69ZZ6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tmcc1Q69ZZ6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tmcc1Q69ZZ6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tmcc1Q69ZZ6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tmcc1Q69ZZ6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tmcc1Q69ZZ6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tmcc1Q69ZZ6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tmcc1Q69ZZ6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tmcc1Q69ZZ6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tmcc1Q69ZZ6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tmcc1Q69ZZ6 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tmcc1Q69ZZ6 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tmcc1Q69ZZ6 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tmcc1Q69ZZ6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tmcc1Q69ZZ6 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tmcc1Q69ZZ6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tmcc1Q69ZZ6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tmcc1Q69ZZ6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tmcc1Q69ZZ6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tmcc1Q69ZZ6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tmcc1Q69ZZ6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tmcc1Q69ZZ6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tmcc1Q69ZZ6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tmcc1Q69ZZ6 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tmcc1Q69ZZ6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tmcc1Q69ZZ6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tmcc1Q69ZZ6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tmcc1Q69ZZ6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tmcc1Q69ZZ6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tmcc1Q69ZZ6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Tmcc1Q69ZZ6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tmcc1Q69ZZ6 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tmcc1Q69ZZ6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tmcc1Q69ZZ6 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tmcc1Q69ZZ6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tmcc1Q69ZZ6 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Tmcc1Q69ZZ6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tmcc1Q69ZZ6 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tmcc1Q69ZZ6 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tmcc1Q69ZZ6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tmcc1Q69ZZ6 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tmcc1Q69ZZ6 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tmcc1Q69ZZ6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tmcc1Q69ZZ6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tmcc1Q69ZZ6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tmcc1Q69ZZ6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tmcc1Q69ZZ6 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tmcc1Q69ZZ6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tmcc1Q69ZZ6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tmcc1Q69ZZ6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tmcc1Q69ZZ6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tmcc1Q69ZZ6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tmcc1Q69ZZ6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tmcc1Q69ZZ6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tmcc1Q69ZZ6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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