Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW7

Patj, InaD-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PatjQ63ZW7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PatjQ63ZW7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PatjQ63ZW7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PatjQ63ZW7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PatjQ63ZW7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PatjQ63ZW7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PatjQ63ZW7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PatjQ63ZW7 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PatjQ63ZW7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PatjQ63ZW7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PatjQ63ZW7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PatjQ63ZW7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PatjQ63ZW7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PatjQ63ZW7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PatjQ63ZW7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PatjQ63ZW7 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PatjQ63ZW7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PatjQ63ZW7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PatjQ63ZW7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PatjQ63ZW7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PatjQ63ZW7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PatjQ63ZW7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PatjQ63ZW7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PatjQ63ZW7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PatjQ63ZW7 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PatjQ63ZW7 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PatjQ63ZW7 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PatjQ63ZW7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PatjQ63ZW7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PatjQ63ZW7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PatjQ63ZW7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PatjQ63ZW7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PatjQ63ZW7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PatjQ63ZW7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PatjQ63ZW7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PatjQ63ZW7 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PatjQ63ZW7 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PatjQ63ZW7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PatjQ63ZW7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PatjQ63ZW7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PatjQ63ZW7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PatjQ63ZW7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PatjQ63ZW7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PatjQ63ZW7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PatjQ63ZW7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PatjQ63ZW7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PatjQ63ZW7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PatjQ63ZW7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PatjQ63ZW7 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PatjQ63ZW7 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PatjQ63ZW7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PatjQ63ZW7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PatjQ63ZW7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PatjQ63ZW7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PatjQ63ZW7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PatjQ63ZW7 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PatjQ63ZW7 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PatjQ63ZW7 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PatjQ63ZW7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PatjQ63ZW7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PatjQ63ZW7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PatjQ63ZW7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PatjQ63ZW7 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PatjQ63ZW7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PatjQ63ZW7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PatjQ63ZW7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PatjQ63ZW7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PatjQ63ZW7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PatjQ63ZW7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PatjQ63ZW7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PatjQ63ZW7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PatjQ63ZW7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PatjQ63ZW7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PatjQ63ZW7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PatjQ63ZW7 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PatjQ63ZW7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PatjQ63ZW7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PatjQ63ZW7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PatjQ63ZW7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PatjQ63ZW7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PatjQ63ZW7 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PatjQ63ZW7 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PatjQ63ZW7 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PatjQ63ZW7 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PatjQ63ZW7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PatjQ63ZW7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PatjQ63ZW7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PatjQ63ZW7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PatjQ63ZW7 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PatjQ63ZW7 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PatjQ63ZW7 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PatjQ63ZW7 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PatjQ63ZW7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PatjQ63ZW7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PatjQ63ZW7 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PatjQ63ZW7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PatjQ63ZW7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PatjQ63ZW7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PatjQ63ZW7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PatjQ63ZW7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms