Protein–RNA interactions for Protein: Q62241

Snrpc, U1 small nuclear ribonucleoprotein C, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpcQ62241 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SnrpcQ62241 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SnrpcQ62241 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SnrpcQ62241 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SnrpcQ62241 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SnrpcQ62241 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SnrpcQ62241 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SnrpcQ62241 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpcQ62241 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpcQ62241 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpcQ62241 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpcQ62241 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpcQ62241 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpcQ62241 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpcQ62241 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpcQ62241 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpcQ62241 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpcQ62241 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpcQ62241 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpcQ62241 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpcQ62241 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpcQ62241 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpcQ62241 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpcQ62241 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpcQ62241 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpcQ62241 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnrpcQ62241 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SnrpcQ62241 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnrpcQ62241 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnrpcQ62241 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnrpcQ62241 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnrpcQ62241 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnrpcQ62241 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnrpcQ62241 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnrpcQ62241 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnrpcQ62241 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SnrpcQ62241 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnrpcQ62241 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnrpcQ62241 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnrpcQ62241 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnrpcQ62241 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnrpcQ62241 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnrpcQ62241 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnrpcQ62241 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnrpcQ62241 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnrpcQ62241 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SnrpcQ62241 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SnrpcQ62241 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SnrpcQ62241 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SnrpcQ62241 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SnrpcQ62241 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SnrpcQ62241 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SnrpcQ62241 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SnrpcQ62241 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SnrpcQ62241 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SnrpcQ62241 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SnrpcQ62241 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SnrpcQ62241 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SnrpcQ62241 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SnrpcQ62241 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SnrpcQ62241 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SnrpcQ62241 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SnrpcQ62241 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SnrpcQ62241 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SnrpcQ62241 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SnrpcQ62241 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SnrpcQ62241 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SnrpcQ62241 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SnrpcQ62241 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SnrpcQ62241 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SnrpcQ62241 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SnrpcQ62241 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SnrpcQ62241 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SnrpcQ62241 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SnrpcQ62241 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SnrpcQ62241 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SnrpcQ62241 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SnrpcQ62241 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SnrpcQ62241 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SnrpcQ62241 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SnrpcQ62241 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SnrpcQ62241 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SnrpcQ62241 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SnrpcQ62241 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SnrpcQ62241 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SnrpcQ62241 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SnrpcQ62241 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SnrpcQ62241 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SnrpcQ62241 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SnrpcQ62241 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SnrpcQ62241 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SnrpcQ62241 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SnrpcQ62241 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SnrpcQ62241 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SnrpcQ62241 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SnrpcQ62241 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SnrpcQ62241 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SnrpcQ62241 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SnrpcQ62241 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SnrpcQ62241 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms