Protein–RNA interactions for Protein: Q62179

Sema4b, Semaphorin-4B, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4bQ62179 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sema4bQ62179 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sema4bQ62179 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sema4bQ62179 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sema4bQ62179 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sema4bQ62179 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sema4bQ62179 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sema4bQ62179 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sema4bQ62179 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sema4bQ62179 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Sema4bQ62179 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sema4bQ62179 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sema4bQ62179 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sema4bQ62179 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sema4bQ62179 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sema4bQ62179 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sema4bQ62179 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sema4bQ62179 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sema4bQ62179 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sema4bQ62179 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sema4bQ62179 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sema4bQ62179 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sema4bQ62179 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sema4bQ62179 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sema4bQ62179 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sema4bQ62179 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sema4bQ62179 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sema4bQ62179 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sema4bQ62179 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sema4bQ62179 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sema4bQ62179 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sema4bQ62179 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Sema4bQ62179 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sema4bQ62179 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sema4bQ62179 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sema4bQ62179 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sema4bQ62179 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sema4bQ62179 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sema4bQ62179 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sema4bQ62179 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sema4bQ62179 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sema4bQ62179 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sema4bQ62179 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sema4bQ62179 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sema4bQ62179 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sema4bQ62179 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sema4bQ62179 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sema4bQ62179 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sema4bQ62179 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Sema4bQ62179 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sema4bQ62179 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sema4bQ62179 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sema4bQ62179 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sema4bQ62179 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sema4bQ62179 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sema4bQ62179 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Sema4bQ62179 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Sema4bQ62179 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Sema4bQ62179 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sema4bQ62179 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sema4bQ62179 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sema4bQ62179 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Sema4bQ62179 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sema4bQ62179 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sema4bQ62179 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sema4bQ62179 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sema4bQ62179 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sema4bQ62179 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sema4bQ62179 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sema4bQ62179 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sema4bQ62179 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sema4bQ62179 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sema4bQ62179 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Sema4bQ62179 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sema4bQ62179 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Sema4bQ62179 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sema4bQ62179 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sema4bQ62179 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sema4bQ62179 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sema4bQ62179 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sema4bQ62179 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sema4bQ62179 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sema4bQ62179 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sema4bQ62179 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sema4bQ62179 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sema4bQ62179 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Sema4bQ62179 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sema4bQ62179 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Sema4bQ62179 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sema4bQ62179 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sema4bQ62179 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sema4bQ62179 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sema4bQ62179 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sema4bQ62179 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sema4bQ62179 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sema4bQ62179 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sema4bQ62179 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sema4bQ62179 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Sema4bQ62179 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Sema4bQ62179 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms