Protein–RNA interactions for Protein: Q61414

Krt15, Keratin, type I cytoskeletal 15, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt15Q61414 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt15Q61414 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt15Q61414 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Krt15Q61414 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Krt15Q61414 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Krt15Q61414 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Krt15Q61414 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Krt15Q61414 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Krt15Q61414 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Krt15Q61414 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Krt15Q61414 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Krt15Q61414 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt15Q61414 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt15Q61414 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt15Q61414 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt15Q61414 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt15Q61414 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt15Q61414 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt15Q61414 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt15Q61414 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt15Q61414 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt15Q61414 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt15Q61414 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt15Q61414 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt15Q61414 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt15Q61414 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt15Q61414 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt15Q61414 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Krt15Q61414 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Krt15Q61414 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Krt15Q61414 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Krt15Q61414 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Krt15Q61414 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Krt15Q61414 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Krt15Q61414 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Krt15Q61414 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Krt15Q61414 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Krt15Q61414 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Krt15Q61414 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Krt15Q61414 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Krt15Q61414 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Krt15Q61414 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Krt15Q61414 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Krt15Q61414 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Krt15Q61414 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Krt15Q61414 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krt15Q61414 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krt15Q61414 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krt15Q61414 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krt15Q61414 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krt15Q61414 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krt15Q61414 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krt15Q61414 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krt15Q61414 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krt15Q61414 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt15Q61414 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt15Q61414 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt15Q61414 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt15Q61414 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt15Q61414 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt15Q61414 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt15Q61414 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt15Q61414 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt15Q61414 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt15Q61414 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt15Q61414 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt15Q61414 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt15Q61414 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt15Q61414 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt15Q61414 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt15Q61414 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt15Q61414 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt15Q61414 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt15Q61414 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt15Q61414 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt15Q61414 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt15Q61414 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt15Q61414 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt15Q61414 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt15Q61414 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt15Q61414 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt15Q61414 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt15Q61414 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt15Q61414 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt15Q61414 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt15Q61414 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt15Q61414 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt15Q61414 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt15Q61414 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt15Q61414 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt15Q61414 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt15Q61414 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt15Q61414 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt15Q61414 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt15Q61414 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt15Q61414 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Krt15Q61414 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Krt15Q61414 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Krt15Q61414 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Krt15Q61414 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms