Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rbbp7Q60973 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rbbp7Q60973 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rbbp7Q60973 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rbbp7Q60973 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rbbp7Q60973 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rbbp7Q60973 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Rbbp7Q60973 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Rbbp7Q60973 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rbbp7Q60973 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rbbp7Q60973 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rbbp7Q60973 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rbbp7Q60973 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rbbp7Q60973 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rbbp7Q60973 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rbbp7Q60973 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rbbp7Q60973 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rbbp7Q60973 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rbbp7Q60973 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rbbp7Q60973 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rbbp7Q60973 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rbbp7Q60973 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rbbp7Q60973 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rbbp7Q60973 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rbbp7Q60973 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rbbp7Q60973 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rbbp7Q60973 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rbbp7Q60973 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rbbp7Q60973 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rbbp7Q60973 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rbbp7Q60973 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rbbp7Q60973 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rbbp7Q60973 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rbbp7Q60973 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rbbp7Q60973 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rbbp7Q60973 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rbbp7Q60973 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rbbp7Q60973 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rbbp7Q60973 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rbbp7Q60973 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rbbp7Q60973 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rbbp7Q60973 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rbbp7Q60973 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rbbp7Q60973 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rbbp7Q60973 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rbbp7Q60973 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rbbp7Q60973 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Rbbp7Q60973 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rbbp7Q60973 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rbbp7Q60973 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rbbp7Q60973 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rbbp7Q60973 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rbbp7Q60973 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rbbp7Q60973 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Rbbp7Q60973 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rbbp7Q60973 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rbbp7Q60973 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rbbp7Q60973 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rbbp7Q60973 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rbbp7Q60973 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rbbp7Q60973 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rbbp7Q60973 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rbbp7Q60973 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rbbp7Q60973 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rbbp7Q60973 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rbbp7Q60973 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rbbp7Q60973 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rbbp7Q60973 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rbbp7Q60973 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rbbp7Q60973 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rbbp7Q60973 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rbbp7Q60973 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rbbp7Q60973 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rbbp7Q60973 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rbbp7Q60973 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rbbp7Q60973 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rbbp7Q60973 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rbbp7Q60973 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rbbp7Q60973 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rbbp7Q60973 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rbbp7Q60973 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rbbp7Q60973 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rbbp7Q60973 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rbbp7Q60973 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rbbp7Q60973 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rbbp7Q60973 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rbbp7Q60973 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Rbbp7Q60973 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rbbp7Q60973 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Rbbp7Q60973 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rbbp7Q60973 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rbbp7Q60973 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rbbp7Q60973 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rbbp7Q60973 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rbbp7Q60973 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Rbbp7Q60973 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Rbbp7Q60973 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Rbbp7Q60973 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Rbbp7Q60973 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rbbp7Q60973 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms