Protein–RNA interactions for Protein: Q60772

Cdkn2c, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor C, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2cQ60772 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cdkn2cQ60772 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cdkn2cQ60772 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cdkn2cQ60772 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Cdkn2cQ60772 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Cdkn2cQ60772 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Cdkn2cQ60772 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cdkn2cQ60772 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cdkn2cQ60772 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cdkn2cQ60772 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cdkn2cQ60772 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cdkn2cQ60772 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cdkn2cQ60772 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cdkn2cQ60772 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cdkn2cQ60772 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cdkn2cQ60772 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cdkn2cQ60772 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cdkn2cQ60772 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cdkn2cQ60772 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Cdkn2cQ60772 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cdkn2cQ60772 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cdkn2cQ60772 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cdkn2cQ60772 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cdkn2cQ60772 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cdkn2cQ60772 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cdkn2cQ60772 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cdkn2cQ60772 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cdkn2cQ60772 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cdkn2cQ60772 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cdkn2cQ60772 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cdkn2cQ60772 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cdkn2cQ60772 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cdkn2cQ60772 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Cdkn2cQ60772 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cdkn2cQ60772 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cdkn2cQ60772 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cdkn2cQ60772 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cdkn2cQ60772 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cdkn2cQ60772 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdkn2cQ60772 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdkn2cQ60772 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdkn2cQ60772 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdkn2cQ60772 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdkn2cQ60772 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdkn2cQ60772 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdkn2cQ60772 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdkn2cQ60772 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdkn2cQ60772 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdkn2cQ60772 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdkn2cQ60772 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdkn2cQ60772 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdkn2cQ60772 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdkn2cQ60772 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdkn2cQ60772 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdkn2cQ60772 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdkn2cQ60772 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdkn2cQ60772 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdkn2cQ60772 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdkn2cQ60772 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdkn2cQ60772 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdkn2cQ60772 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdkn2cQ60772 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdkn2cQ60772 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdkn2cQ60772 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdkn2cQ60772 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdkn2cQ60772 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdkn2cQ60772 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cdkn2cQ60772 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cdkn2cQ60772 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cdkn2cQ60772 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cdkn2cQ60772 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cdkn2cQ60772 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cdkn2cQ60772 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cdkn2cQ60772 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cdkn2cQ60772 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cdkn2cQ60772 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdkn2cQ60772 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdkn2cQ60772 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdkn2cQ60772 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdkn2cQ60772 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdkn2cQ60772 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdkn2cQ60772 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdkn2cQ60772 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdkn2cQ60772 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdkn2cQ60772 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdkn2cQ60772 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdkn2cQ60772 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdkn2cQ60772 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdkn2cQ60772 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdkn2cQ60772 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdkn2cQ60772 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdkn2cQ60772 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdkn2cQ60772 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdkn2cQ60772 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdkn2cQ60772 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdkn2cQ60772 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdkn2cQ60772 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cdkn2cQ60772 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cdkn2cQ60772 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cdkn2cQ60772 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms