Protein–RNA interactions for Protein: Q60519

Sema5b, Semaphorin-5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema5bQ60519 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sema5bQ60519 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sema5bQ60519 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sema5bQ60519 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sema5bQ60519 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sema5bQ60519 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Sema5bQ60519 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sema5bQ60519 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sema5bQ60519 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sema5bQ60519 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sema5bQ60519 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sema5bQ60519 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sema5bQ60519 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sema5bQ60519 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sema5bQ60519 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sema5bQ60519 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sema5bQ60519 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sema5bQ60519 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sema5bQ60519 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sema5bQ60519 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sema5bQ60519 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sema5bQ60519 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sema5bQ60519 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sema5bQ60519 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sema5bQ60519 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sema5bQ60519 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Sema5bQ60519 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sema5bQ60519 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sema5bQ60519 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sema5bQ60519 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sema5bQ60519 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sema5bQ60519 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sema5bQ60519 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sema5bQ60519 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sema5bQ60519 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sema5bQ60519 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sema5bQ60519 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sema5bQ60519 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sema5bQ60519 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sema5bQ60519 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sema5bQ60519 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Sema5bQ60519 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sema5bQ60519 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sema5bQ60519 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sema5bQ60519 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sema5bQ60519 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sema5bQ60519 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sema5bQ60519 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sema5bQ60519 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sema5bQ60519 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sema5bQ60519 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sema5bQ60519 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sema5bQ60519 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sema5bQ60519 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sema5bQ60519 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sema5bQ60519 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sema5bQ60519 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sema5bQ60519 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sema5bQ60519 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sema5bQ60519 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sema5bQ60519 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sema5bQ60519 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sema5bQ60519 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sema5bQ60519 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sema5bQ60519 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sema5bQ60519 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sema5bQ60519 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
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Sema5bQ60519 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sema5bQ60519 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Sema5bQ60519 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sema5bQ60519 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sema5bQ60519 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sema5bQ60519 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sema5bQ60519 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sema5bQ60519 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Sema5bQ60519 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sema5bQ60519 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sema5bQ60519 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sema5bQ60519 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sema5bQ60519 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sema5bQ60519 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sema5bQ60519 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sema5bQ60519 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Sema5bQ60519 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sema5bQ60519 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sema5bQ60519 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Sema5bQ60519 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Sema5bQ60519 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sema5bQ60519 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sema5bQ60519 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sema5bQ60519 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sema5bQ60519 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sema5bQ60519 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sema5bQ60519 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sema5bQ60519 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sema5bQ60519 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sema5bQ60519 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sema5bQ60519 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sema5bQ60519 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms