Protein–RNA interactions for Protein: Q5YD48

A1cf, APOBEC1 complementation factor, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A1cfQ5YD48 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A1cfQ5YD48 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A1cfQ5YD48 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A1cfQ5YD48 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A1cfQ5YD48 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A1cfQ5YD48 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A1cfQ5YD48 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A1cfQ5YD48 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A1cfQ5YD48 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A1cfQ5YD48 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A1cfQ5YD48 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A1cfQ5YD48 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A1cfQ5YD48 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A1cfQ5YD48 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A1cfQ5YD48 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A1cfQ5YD48 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A1cfQ5YD48 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A1cfQ5YD48 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A1cfQ5YD48 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A1cfQ5YD48 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A1cfQ5YD48 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A1cfQ5YD48 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A1cfQ5YD48 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A1cfQ5YD48 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A1cfQ5YD48 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A1cfQ5YD48 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A1cfQ5YD48 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A1cfQ5YD48 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
A1cfQ5YD48 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
A1cfQ5YD48 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
A1cfQ5YD48 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A1cfQ5YD48 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A1cfQ5YD48 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A1cfQ5YD48 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
A1cfQ5YD48 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A1cfQ5YD48 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A1cfQ5YD48 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A1cfQ5YD48 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A1cfQ5YD48 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
A1cfQ5YD48 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A1cfQ5YD48 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A1cfQ5YD48 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A1cfQ5YD48 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A1cfQ5YD48 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A1cfQ5YD48 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A1cfQ5YD48 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A1cfQ5YD48 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A1cfQ5YD48 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A1cfQ5YD48 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A1cfQ5YD48 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A1cfQ5YD48 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
A1cfQ5YD48 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
A1cfQ5YD48 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A1cfQ5YD48 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A1cfQ5YD48 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A1cfQ5YD48 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A1cfQ5YD48 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A1cfQ5YD48 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A1cfQ5YD48 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A1cfQ5YD48 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
A1cfQ5YD48 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
A1cfQ5YD48 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A1cfQ5YD48 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A1cfQ5YD48 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
A1cfQ5YD48 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
A1cfQ5YD48 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
A1cfQ5YD48 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A1cfQ5YD48 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A1cfQ5YD48 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A1cfQ5YD48 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A1cfQ5YD48 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A1cfQ5YD48 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A1cfQ5YD48 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A1cfQ5YD48 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A1cfQ5YD48 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A1cfQ5YD48 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A1cfQ5YD48 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A1cfQ5YD48 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A1cfQ5YD48 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A1cfQ5YD48 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A1cfQ5YD48 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A1cfQ5YD48 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A1cfQ5YD48 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A1cfQ5YD48 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A1cfQ5YD48 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A1cfQ5YD48 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A1cfQ5YD48 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A1cfQ5YD48 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A1cfQ5YD48 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A1cfQ5YD48 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A1cfQ5YD48 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A1cfQ5YD48 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A1cfQ5YD48 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
A1cfQ5YD48 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
A1cfQ5YD48 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
A1cfQ5YD48 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
A1cfQ5YD48 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
A1cfQ5YD48 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
A1cfQ5YD48 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
A1cfQ5YD48 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms