Protein–RNA interactions for Protein: Q5U5Q9

Uimc1, BRCA1-A complex subunit RAP80, mousemouse

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Length 727 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uimc1Q5U5Q9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Uimc1Q5U5Q9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Uimc1Q5U5Q9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Uimc1Q5U5Q9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Uimc1Q5U5Q9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Uimc1Q5U5Q9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Uimc1Q5U5Q9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Uimc1Q5U5Q9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Uimc1Q5U5Q9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Uimc1Q5U5Q9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Uimc1Q5U5Q9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Uimc1Q5U5Q9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Uimc1Q5U5Q9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Uimc1Q5U5Q9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Uimc1Q5U5Q9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Uimc1Q5U5Q9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Uimc1Q5U5Q9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Uimc1Q5U5Q9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Uimc1Q5U5Q9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Uimc1Q5U5Q9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Uimc1Q5U5Q9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Uimc1Q5U5Q9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Uimc1Q5U5Q9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Uimc1Q5U5Q9 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Uimc1Q5U5Q9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Uimc1Q5U5Q9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Uimc1Q5U5Q9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Uimc1Q5U5Q9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Uimc1Q5U5Q9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Uimc1Q5U5Q9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Uimc1Q5U5Q9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Uimc1Q5U5Q9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Uimc1Q5U5Q9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Uimc1Q5U5Q9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Uimc1Q5U5Q9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Uimc1Q5U5Q9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Uimc1Q5U5Q9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Uimc1Q5U5Q9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Uimc1Q5U5Q9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Uimc1Q5U5Q9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Uimc1Q5U5Q9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Uimc1Q5U5Q9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Uimc1Q5U5Q9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Uimc1Q5U5Q9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Uimc1Q5U5Q9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Uimc1Q5U5Q9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Uimc1Q5U5Q9 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Uimc1Q5U5Q9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Uimc1Q5U5Q9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Uimc1Q5U5Q9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Uimc1Q5U5Q9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Uimc1Q5U5Q9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Uimc1Q5U5Q9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Uimc1Q5U5Q9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Uimc1Q5U5Q9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Uimc1Q5U5Q9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Uimc1Q5U5Q9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Uimc1Q5U5Q9 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Uimc1Q5U5Q9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Uimc1Q5U5Q9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Uimc1Q5U5Q9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Uimc1Q5U5Q9 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Uimc1Q5U5Q9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Uimc1Q5U5Q9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Uimc1Q5U5Q9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Uimc1Q5U5Q9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Uimc1Q5U5Q9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
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Uimc1Q5U5Q9 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Uimc1Q5U5Q9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Uimc1Q5U5Q9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Uimc1Q5U5Q9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Uimc1Q5U5Q9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Uimc1Q5U5Q9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Uimc1Q5U5Q9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Uimc1Q5U5Q9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Uimc1Q5U5Q9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Uimc1Q5U5Q9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Uimc1Q5U5Q9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Uimc1Q5U5Q9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Uimc1Q5U5Q9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Uimc1Q5U5Q9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Uimc1Q5U5Q9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Uimc1Q5U5Q9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Uimc1Q5U5Q9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Uimc1Q5U5Q9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Uimc1Q5U5Q9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Uimc1Q5U5Q9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Uimc1Q5U5Q9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Uimc1Q5U5Q9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Uimc1Q5U5Q9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Uimc1Q5U5Q9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Uimc1Q5U5Q9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Uimc1Q5U5Q9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Uimc1Q5U5Q9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Uimc1Q5U5Q9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Uimc1Q5U5Q9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Uimc1Q5U5Q9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Uimc1Q5U5Q9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Uimc1Q5U5Q9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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