Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sft2d1Q5SSN7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sft2d1Q5SSN7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sft2d1Q5SSN7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sft2d1Q5SSN7 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sft2d1Q5SSN7 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sft2d1Q5SSN7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sft2d1Q5SSN7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sft2d1Q5SSN7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sft2d1Q5SSN7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sft2d1Q5SSN7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sft2d1Q5SSN7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sft2d1Q5SSN7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sft2d1Q5SSN7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sft2d1Q5SSN7 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sft2d1Q5SSN7 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sft2d1Q5SSN7 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sft2d1Q5SSN7 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sft2d1Q5SSN7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sft2d1Q5SSN7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sft2d1Q5SSN7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sft2d1Q5SSN7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sft2d1Q5SSN7 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sft2d1Q5SSN7 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sft2d1Q5SSN7 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sft2d1Q5SSN7 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sft2d1Q5SSN7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sft2d1Q5SSN7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sft2d1Q5SSN7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sft2d1Q5SSN7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Sft2d1Q5SSN7 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sft2d1Q5SSN7 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sft2d1Q5SSN7 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sft2d1Q5SSN7 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sft2d1Q5SSN7 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sft2d1Q5SSN7 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sft2d1Q5SSN7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sft2d1Q5SSN7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sft2d1Q5SSN7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sft2d1Q5SSN7 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sft2d1Q5SSN7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sft2d1Q5SSN7 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sft2d1Q5SSN7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sft2d1Q5SSN7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sft2d1Q5SSN7 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sft2d1Q5SSN7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sft2d1Q5SSN7 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sft2d1Q5SSN7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sft2d1Q5SSN7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sft2d1Q5SSN7 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sft2d1Q5SSN7 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sft2d1Q5SSN7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sft2d1Q5SSN7 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sft2d1Q5SSN7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sft2d1Q5SSN7 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sft2d1Q5SSN7 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sft2d1Q5SSN7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sft2d1Q5SSN7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sft2d1Q5SSN7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sft2d1Q5SSN7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sft2d1Q5SSN7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sft2d1Q5SSN7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sft2d1Q5SSN7 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sft2d1Q5SSN7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sft2d1Q5SSN7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sft2d1Q5SSN7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sft2d1Q5SSN7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sft2d1Q5SSN7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sft2d1Q5SSN7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sft2d1Q5SSN7 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sft2d1Q5SSN7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sft2d1Q5SSN7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sft2d1Q5SSN7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sft2d1Q5SSN7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sft2d1Q5SSN7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sft2d1Q5SSN7 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sft2d1Q5SSN7 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sft2d1Q5SSN7 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sft2d1Q5SSN7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sft2d1Q5SSN7 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sft2d1Q5SSN7 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sft2d1Q5SSN7 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sft2d1Q5SSN7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sft2d1Q5SSN7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sft2d1Q5SSN7 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sft2d1Q5SSN7 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sft2d1Q5SSN7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sft2d1Q5SSN7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sft2d1Q5SSN7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sft2d1Q5SSN7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sft2d1Q5SSN7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sft2d1Q5SSN7 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sft2d1Q5SSN7 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sft2d1Q5SSN7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sft2d1Q5SSN7 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sft2d1Q5SSN7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sft2d1Q5SSN7 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sft2d1Q5SSN7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms