Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC57

Fam183b, Protein FAM183B, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam183bQ5NC57 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fam183bQ5NC57 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fam183bQ5NC57 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fam183bQ5NC57 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fam183bQ5NC57 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fam183bQ5NC57 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fam183bQ5NC57 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fam183bQ5NC57 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fam183bQ5NC57 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fam183bQ5NC57 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fam183bQ5NC57 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fam183bQ5NC57 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fam183bQ5NC57 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fam183bQ5NC57 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fam183bQ5NC57 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fam183bQ5NC57 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fam183bQ5NC57 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fam183bQ5NC57 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam183bQ5NC57 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam183bQ5NC57 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam183bQ5NC57 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam183bQ5NC57 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam183bQ5NC57 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam183bQ5NC57 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam183bQ5NC57 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam183bQ5NC57 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam183bQ5NC57 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam183bQ5NC57 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam183bQ5NC57 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam183bQ5NC57 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam183bQ5NC57 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam183bQ5NC57 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam183bQ5NC57 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam183bQ5NC57 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam183bQ5NC57 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam183bQ5NC57 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam183bQ5NC57 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam183bQ5NC57 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam183bQ5NC57 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam183bQ5NC57 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fam183bQ5NC57 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fam183bQ5NC57 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fam183bQ5NC57 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fam183bQ5NC57 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fam183bQ5NC57 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fam183bQ5NC57 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fam183bQ5NC57 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fam183bQ5NC57 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fam183bQ5NC57 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fam183bQ5NC57 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fam183bQ5NC57 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Fam183bQ5NC57 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Fam183bQ5NC57 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Fam183bQ5NC57 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam183bQ5NC57 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam183bQ5NC57 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam183bQ5NC57 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam183bQ5NC57 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam183bQ5NC57 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam183bQ5NC57 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam183bQ5NC57 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam183bQ5NC57 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam183bQ5NC57 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam183bQ5NC57 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam183bQ5NC57 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam183bQ5NC57 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam183bQ5NC57 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam183bQ5NC57 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam183bQ5NC57 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam183bQ5NC57 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam183bQ5NC57 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam183bQ5NC57 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam183bQ5NC57 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam183bQ5NC57 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam183bQ5NC57 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam183bQ5NC57 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam183bQ5NC57 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam183bQ5NC57 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam183bQ5NC57 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam183bQ5NC57 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam183bQ5NC57 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam183bQ5NC57 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam183bQ5NC57 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam183bQ5NC57 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam183bQ5NC57 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam183bQ5NC57 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam183bQ5NC57 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam183bQ5NC57 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam183bQ5NC57 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam183bQ5NC57 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam183bQ5NC57 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam183bQ5NC57 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam183bQ5NC57 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam183bQ5NC57 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam183bQ5NC57 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fam183bQ5NC57 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fam183bQ5NC57 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fam183bQ5NC57 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fam183bQ5NC57 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fam183bQ5NC57 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms