Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJN1

C1qtnf9, Complement C1q and tumor necrosis factor-related protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1qtnf9Q4ZJN1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C1qtnf9Q4ZJN1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C1qtnf9Q4ZJN1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C1qtnf9Q4ZJN1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C1qtnf9Q4ZJN1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
C1qtnf9Q4ZJN1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C1qtnf9Q4ZJN1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C1qtnf9Q4ZJN1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C1qtnf9Q4ZJN1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C1qtnf9Q4ZJN1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C1qtnf9Q4ZJN1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C1qtnf9Q4ZJN1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C1qtnf9Q4ZJN1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C1qtnf9Q4ZJN1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C1qtnf9Q4ZJN1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C1qtnf9Q4ZJN1 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C1qtnf9Q4ZJN1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C1qtnf9Q4ZJN1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C1qtnf9Q4ZJN1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C1qtnf9Q4ZJN1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C1qtnf9Q4ZJN1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C1qtnf9Q4ZJN1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C1qtnf9Q4ZJN1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C1qtnf9Q4ZJN1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C1qtnf9Q4ZJN1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C1qtnf9Q4ZJN1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C1qtnf9Q4ZJN1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C1qtnf9Q4ZJN1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C1qtnf9Q4ZJN1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C1qtnf9Q4ZJN1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C1qtnf9Q4ZJN1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C1qtnf9Q4ZJN1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C1qtnf9Q4ZJN1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C1qtnf9Q4ZJN1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C1qtnf9Q4ZJN1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C1qtnf9Q4ZJN1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C1qtnf9Q4ZJN1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C1qtnf9Q4ZJN1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C1qtnf9Q4ZJN1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C1qtnf9Q4ZJN1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
C1qtnf9Q4ZJN1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C1qtnf9Q4ZJN1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C1qtnf9Q4ZJN1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C1qtnf9Q4ZJN1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C1qtnf9Q4ZJN1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C1qtnf9Q4ZJN1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C1qtnf9Q4ZJN1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C1qtnf9Q4ZJN1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C1qtnf9Q4ZJN1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C1qtnf9Q4ZJN1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C1qtnf9Q4ZJN1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C1qtnf9Q4ZJN1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C1qtnf9Q4ZJN1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C1qtnf9Q4ZJN1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C1qtnf9Q4ZJN1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C1qtnf9Q4ZJN1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C1qtnf9Q4ZJN1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1qtnf9Q4ZJN1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1qtnf9Q4ZJN1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1qtnf9Q4ZJN1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1qtnf9Q4ZJN1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1qtnf9Q4ZJN1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1qtnf9Q4ZJN1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1qtnf9Q4ZJN1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1qtnf9Q4ZJN1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1qtnf9Q4ZJN1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
C1qtnf9Q4ZJN1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1qtnf9Q4ZJN1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
C1qtnf9Q4ZJN1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1qtnf9Q4ZJN1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1qtnf9Q4ZJN1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1qtnf9Q4ZJN1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1qtnf9Q4ZJN1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1qtnf9Q4ZJN1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1qtnf9Q4ZJN1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1qtnf9Q4ZJN1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1qtnf9Q4ZJN1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1qtnf9Q4ZJN1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1qtnf9Q4ZJN1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1qtnf9Q4ZJN1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C1qtnf9Q4ZJN1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C1qtnf9Q4ZJN1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C1qtnf9Q4ZJN1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C1qtnf9Q4ZJN1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C1qtnf9Q4ZJN1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
C1qtnf9Q4ZJN1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C1qtnf9Q4ZJN1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C1qtnf9Q4ZJN1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms