Protein–RNA interactions for Protein: Q4V9W2

Srek1ip1, Protein SREK1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srek1ip1Q4V9W2 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srek1ip1Q4V9W2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srek1ip1Q4V9W2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srek1ip1Q4V9W2 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srek1ip1Q4V9W2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srek1ip1Q4V9W2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srek1ip1Q4V9W2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srek1ip1Q4V9W2 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srek1ip1Q4V9W2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srek1ip1Q4V9W2 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srek1ip1Q4V9W2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srek1ip1Q4V9W2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srek1ip1Q4V9W2 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srek1ip1Q4V9W2 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srek1ip1Q4V9W2 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Srek1ip1Q4V9W2 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Srek1ip1Q4V9W2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Srek1ip1Q4V9W2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Srek1ip1Q4V9W2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Srek1ip1Q4V9W2 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Srek1ip1Q4V9W2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Srek1ip1Q4V9W2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srek1ip1Q4V9W2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srek1ip1Q4V9W2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srek1ip1Q4V9W2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srek1ip1Q4V9W2 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srek1ip1Q4V9W2 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srek1ip1Q4V9W2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srek1ip1Q4V9W2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srek1ip1Q4V9W2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srek1ip1Q4V9W2 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srek1ip1Q4V9W2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Srek1ip1Q4V9W2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srek1ip1Q4V9W2 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srek1ip1Q4V9W2 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srek1ip1Q4V9W2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srek1ip1Q4V9W2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Srek1ip1Q4V9W2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Srek1ip1Q4V9W2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Srek1ip1Q4V9W2 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Srek1ip1Q4V9W2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Srek1ip1Q4V9W2 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Srek1ip1Q4V9W2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Srek1ip1Q4V9W2 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Srek1ip1Q4V9W2 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Srek1ip1Q4V9W2 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Srek1ip1Q4V9W2 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Srek1ip1Q4V9W2 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Srek1ip1Q4V9W2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Srek1ip1Q4V9W2 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Srek1ip1Q4V9W2 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Srek1ip1Q4V9W2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Srek1ip1Q4V9W2 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Srek1ip1Q4V9W2 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Srek1ip1Q4V9W2 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Srek1ip1Q4V9W2 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Srek1ip1Q4V9W2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Srek1ip1Q4V9W2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Srek1ip1Q4V9W2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Srek1ip1Q4V9W2 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Srek1ip1Q4V9W2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Srek1ip1Q4V9W2 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Srek1ip1Q4V9W2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Srek1ip1Q4V9W2 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Srek1ip1Q4V9W2 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Srek1ip1Q4V9W2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Srek1ip1Q4V9W2 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Srek1ip1Q4V9W2 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Srek1ip1Q4V9W2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Srek1ip1Q4V9W2 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Srek1ip1Q4V9W2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Srek1ip1Q4V9W2 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Srek1ip1Q4V9W2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Srek1ip1Q4V9W2 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Srek1ip1Q4V9W2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Srek1ip1Q4V9W2 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Srek1ip1Q4V9W2 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Srek1ip1Q4V9W2 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Srek1ip1Q4V9W2 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Srek1ip1Q4V9W2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Srek1ip1Q4V9W2 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Srek1ip1Q4V9W2 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Srek1ip1Q4V9W2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Srek1ip1Q4V9W2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Srek1ip1Q4V9W2 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Srek1ip1Q4V9W2 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Srek1ip1Q4V9W2 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Srek1ip1Q4V9W2 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Srek1ip1Q4V9W2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Srek1ip1Q4V9W2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Srek1ip1Q4V9W2 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Srek1ip1Q4V9W2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Srek1ip1Q4V9W2 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Srek1ip1Q4V9W2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Srek1ip1Q4V9W2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Srek1ip1Q4V9W2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Srek1ip1Q4V9W2 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Srek1ip1Q4V9W2 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Srek1ip1Q4V9W2 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Srek1ip1Q4V9W2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms