Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0X1

Smim9, Small integral membrane protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim9Q3V0X1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim9Q3V0X1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim9Q3V0X1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim9Q3V0X1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim9Q3V0X1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim9Q3V0X1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim9Q3V0X1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim9Q3V0X1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim9Q3V0X1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim9Q3V0X1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim9Q3V0X1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim9Q3V0X1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim9Q3V0X1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim9Q3V0X1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim9Q3V0X1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim9Q3V0X1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim9Q3V0X1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim9Q3V0X1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim9Q3V0X1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim9Q3V0X1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim9Q3V0X1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim9Q3V0X1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim9Q3V0X1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim9Q3V0X1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim9Q3V0X1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim9Q3V0X1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim9Q3V0X1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim9Q3V0X1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim9Q3V0X1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim9Q3V0X1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim9Q3V0X1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim9Q3V0X1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim9Q3V0X1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim9Q3V0X1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim9Q3V0X1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim9Q3V0X1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim9Q3V0X1 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim9Q3V0X1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim9Q3V0X1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim9Q3V0X1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim9Q3V0X1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim9Q3V0X1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim9Q3V0X1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim9Q3V0X1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim9Q3V0X1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim9Q3V0X1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim9Q3V0X1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim9Q3V0X1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim9Q3V0X1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim9Q3V0X1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim9Q3V0X1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim9Q3V0X1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim9Q3V0X1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim9Q3V0X1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim9Q3V0X1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim9Q3V0X1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim9Q3V0X1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim9Q3V0X1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim9Q3V0X1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim9Q3V0X1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim9Q3V0X1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim9Q3V0X1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim9Q3V0X1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim9Q3V0X1 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim9Q3V0X1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim9Q3V0X1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim9Q3V0X1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim9Q3V0X1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim9Q3V0X1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim9Q3V0X1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim9Q3V0X1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim9Q3V0X1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim9Q3V0X1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim9Q3V0X1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim9Q3V0X1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim9Q3V0X1 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim9Q3V0X1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim9Q3V0X1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim9Q3V0X1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim9Q3V0X1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim9Q3V0X1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim9Q3V0X1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim9Q3V0X1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim9Q3V0X1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim9Q3V0X1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim9Q3V0X1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim9Q3V0X1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim9Q3V0X1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim9Q3V0X1 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim9Q3V0X1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim9Q3V0X1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim9Q3V0X1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim9Q3V0X1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim9Q3V0X1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim9Q3V0X1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim9Q3V0X1 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim9Q3V0X1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim9Q3V0X1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim9Q3V0X1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim9Q3V0X1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms