Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0G7

Garnl3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garnl3Q3V0G7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Garnl3Q3V0G7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Garnl3Q3V0G7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Garnl3Q3V0G7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Garnl3Q3V0G7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Garnl3Q3V0G7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Garnl3Q3V0G7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Garnl3Q3V0G7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Garnl3Q3V0G7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Garnl3Q3V0G7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Garnl3Q3V0G7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Garnl3Q3V0G7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Garnl3Q3V0G7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Garnl3Q3V0G7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Garnl3Q3V0G7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Garnl3Q3V0G7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Garnl3Q3V0G7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Garnl3Q3V0G7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Garnl3Q3V0G7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Garnl3Q3V0G7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Garnl3Q3V0G7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Garnl3Q3V0G7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Garnl3Q3V0G7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Garnl3Q3V0G7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Garnl3Q3V0G7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Garnl3Q3V0G7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Garnl3Q3V0G7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Garnl3Q3V0G7 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Garnl3Q3V0G7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Garnl3Q3V0G7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Garnl3Q3V0G7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Garnl3Q3V0G7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Garnl3Q3V0G7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Garnl3Q3V0G7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Garnl3Q3V0G7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Garnl3Q3V0G7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Garnl3Q3V0G7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Garnl3Q3V0G7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Garnl3Q3V0G7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Garnl3Q3V0G7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Garnl3Q3V0G7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Garnl3Q3V0G7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Garnl3Q3V0G7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Garnl3Q3V0G7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Garnl3Q3V0G7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Garnl3Q3V0G7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Garnl3Q3V0G7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Garnl3Q3V0G7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Garnl3Q3V0G7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Garnl3Q3V0G7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Garnl3Q3V0G7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Garnl3Q3V0G7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Garnl3Q3V0G7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Garnl3Q3V0G7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Garnl3Q3V0G7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Garnl3Q3V0G7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Garnl3Q3V0G7 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Garnl3Q3V0G7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Garnl3Q3V0G7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Garnl3Q3V0G7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Garnl3Q3V0G7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Garnl3Q3V0G7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Garnl3Q3V0G7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Garnl3Q3V0G7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Garnl3Q3V0G7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Garnl3Q3V0G7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Garnl3Q3V0G7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Garnl3Q3V0G7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Garnl3Q3V0G7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Garnl3Q3V0G7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Garnl3Q3V0G7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Garnl3Q3V0G7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Garnl3Q3V0G7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Garnl3Q3V0G7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Garnl3Q3V0G7 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Garnl3Q3V0G7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Garnl3Q3V0G7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Garnl3Q3V0G7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Garnl3Q3V0G7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Garnl3Q3V0G7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Garnl3Q3V0G7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Garnl3Q3V0G7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Garnl3Q3V0G7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Garnl3Q3V0G7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Garnl3Q3V0G7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Garnl3Q3V0G7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Garnl3Q3V0G7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Garnl3Q3V0G7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Garnl3Q3V0G7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Garnl3Q3V0G7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Garnl3Q3V0G7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Garnl3Q3V0G7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Garnl3Q3V0G7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Garnl3Q3V0G7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Garnl3Q3V0G7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Garnl3Q3V0G7 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Garnl3Q3V0G7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Garnl3Q3V0G7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Garnl3Q3V0G7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Garnl3Q3V0G7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms