Protein–RNA interactions for Protein: Q3V063

4933416C03Rik, MCG64776, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933416C03RikQ3V063 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
4933416C03RikQ3V063 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
4933416C03RikQ3V063 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
4933416C03RikQ3V063 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
4933416C03RikQ3V063 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
4933416C03RikQ3V063 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
4933416C03RikQ3V063 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
4933416C03RikQ3V063 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
4933416C03RikQ3V063 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
4933416C03RikQ3V063 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
4933416C03RikQ3V063 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
4933416C03RikQ3V063 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
4933416C03RikQ3V063 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
4933416C03RikQ3V063 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
4933416C03RikQ3V063 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
4933416C03RikQ3V063 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
4933416C03RikQ3V063 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
4933416C03RikQ3V063 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
4933416C03RikQ3V063 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
4933416C03RikQ3V063 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
4933416C03RikQ3V063 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
4933416C03RikQ3V063 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
4933416C03RikQ3V063 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
4933416C03RikQ3V063 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
4933416C03RikQ3V063 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
4933416C03RikQ3V063 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
4933416C03RikQ3V063 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
4933416C03RikQ3V063 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
4933416C03RikQ3V063 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
4933416C03RikQ3V063 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
4933416C03RikQ3V063 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
4933416C03RikQ3V063 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
4933416C03RikQ3V063 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
4933416C03RikQ3V063 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
4933416C03RikQ3V063 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
4933416C03RikQ3V063 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
4933416C03RikQ3V063 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
4933416C03RikQ3V063 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
4933416C03RikQ3V063 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
4933416C03RikQ3V063 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
4933416C03RikQ3V063 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
4933416C03RikQ3V063 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
4933416C03RikQ3V063 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
4933416C03RikQ3V063 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
4933416C03RikQ3V063 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
4933416C03RikQ3V063 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
4933416C03RikQ3V063 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
4933416C03RikQ3V063 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
4933416C03RikQ3V063 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
4933416C03RikQ3V063 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
4933416C03RikQ3V063 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
4933416C03RikQ3V063 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
4933416C03RikQ3V063 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
4933416C03RikQ3V063 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
4933416C03RikQ3V063 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
4933416C03RikQ3V063 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
4933416C03RikQ3V063 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
4933416C03RikQ3V063 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
4933416C03RikQ3V063 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
4933416C03RikQ3V063 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
4933416C03RikQ3V063 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
4933416C03RikQ3V063 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
4933416C03RikQ3V063 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
4933416C03RikQ3V063 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
4933416C03RikQ3V063 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
4933416C03RikQ3V063 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
4933416C03RikQ3V063 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
4933416C03RikQ3V063 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
4933416C03RikQ3V063 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
4933416C03RikQ3V063 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
4933416C03RikQ3V063 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
4933416C03RikQ3V063 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
4933416C03RikQ3V063 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
4933416C03RikQ3V063 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
4933416C03RikQ3V063 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
4933416C03RikQ3V063 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
4933416C03RikQ3V063 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
4933416C03RikQ3V063 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
4933416C03RikQ3V063 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
4933416C03RikQ3V063 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
4933416C03RikQ3V063 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
4933416C03RikQ3V063 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
4933416C03RikQ3V063 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
4933416C03RikQ3V063 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
4933416C03RikQ3V063 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
4933416C03RikQ3V063 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
4933416C03RikQ3V063 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
4933416C03RikQ3V063 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
4933416C03RikQ3V063 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
4933416C03RikQ3V063 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
4933416C03RikQ3V063 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
4933416C03RikQ3V063 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
4933416C03RikQ3V063 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
4933416C03RikQ3V063 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
4933416C03RikQ3V063 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
4933416C03RikQ3V063 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
4933416C03RikQ3V063 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
4933416C03RikQ3V063 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
4933416C03RikQ3V063 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
4933416C03RikQ3V063 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms