Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV5

Skap1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap1Q3UUV5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Skap1Q3UUV5 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Skap1Q3UUV5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Skap1Q3UUV5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Skap1Q3UUV5 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Skap1Q3UUV5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Skap1Q3UUV5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Skap1Q3UUV5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Skap1Q3UUV5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Skap1Q3UUV5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Skap1Q3UUV5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Skap1Q3UUV5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Skap1Q3UUV5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Skap1Q3UUV5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Skap1Q3UUV5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Skap1Q3UUV5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Skap1Q3UUV5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Skap1Q3UUV5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Skap1Q3UUV5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Skap1Q3UUV5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Skap1Q3UUV5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Skap1Q3UUV5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Skap1Q3UUV5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Skap1Q3UUV5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Skap1Q3UUV5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Skap1Q3UUV5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Skap1Q3UUV5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Skap1Q3UUV5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Skap1Q3UUV5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Skap1Q3UUV5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Skap1Q3UUV5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Skap1Q3UUV5 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Skap1Q3UUV5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Skap1Q3UUV5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Skap1Q3UUV5 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Skap1Q3UUV5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Skap1Q3UUV5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Skap1Q3UUV5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Skap1Q3UUV5 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Skap1Q3UUV5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Skap1Q3UUV5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Skap1Q3UUV5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Skap1Q3UUV5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Skap1Q3UUV5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Skap1Q3UUV5 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Skap1Q3UUV5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Skap1Q3UUV5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Skap1Q3UUV5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Skap1Q3UUV5 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Skap1Q3UUV5 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Skap1Q3UUV5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Skap1Q3UUV5 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Skap1Q3UUV5 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Skap1Q3UUV5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Skap1Q3UUV5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Skap1Q3UUV5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Skap1Q3UUV5 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Skap1Q3UUV5 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Skap1Q3UUV5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Skap1Q3UUV5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Skap1Q3UUV5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Skap1Q3UUV5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Skap1Q3UUV5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Skap1Q3UUV5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Skap1Q3UUV5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Skap1Q3UUV5 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Skap1Q3UUV5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Skap1Q3UUV5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Skap1Q3UUV5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Skap1Q3UUV5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Skap1Q3UUV5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Skap1Q3UUV5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Skap1Q3UUV5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Skap1Q3UUV5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Skap1Q3UUV5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Skap1Q3UUV5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Skap1Q3UUV5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Skap1Q3UUV5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Skap1Q3UUV5 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Skap1Q3UUV5 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Skap1Q3UUV5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Skap1Q3UUV5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Skap1Q3UUV5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Skap1Q3UUV5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Skap1Q3UUV5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Skap1Q3UUV5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Skap1Q3UUV5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Skap1Q3UUV5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Skap1Q3UUV5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Skap1Q3UUV5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Skap1Q3UUV5 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Skap1Q3UUV5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Skap1Q3UUV5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Skap1Q3UUV5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Skap1Q3UUV5 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Skap1Q3UUV5 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Skap1Q3UUV5 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Skap1Q3UUV5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Skap1Q3UUV5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Skap1Q3UUV5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms