Protein–RNA interactions for Protein: Q3USF0

B3gnt6, Acetylgalactosaminyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B3gnt6Q3USF0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
B3gnt6Q3USF0 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
B3gnt6Q3USF0 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
B3gnt6Q3USF0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
B3gnt6Q3USF0 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
B3gnt6Q3USF0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
B3gnt6Q3USF0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
B3gnt6Q3USF0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
B3gnt6Q3USF0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
B3gnt6Q3USF0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
B3gnt6Q3USF0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
B3gnt6Q3USF0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
B3gnt6Q3USF0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
B3gnt6Q3USF0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
B3gnt6Q3USF0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
B3gnt6Q3USF0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
B3gnt6Q3USF0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
B3gnt6Q3USF0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
B3gnt6Q3USF0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
B3gnt6Q3USF0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
B3gnt6Q3USF0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
B3gnt6Q3USF0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
B3gnt6Q3USF0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
B3gnt6Q3USF0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
B3gnt6Q3USF0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
B3gnt6Q3USF0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
B3gnt6Q3USF0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
B3gnt6Q3USF0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
B3gnt6Q3USF0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
B3gnt6Q3USF0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
B3gnt6Q3USF0 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
B3gnt6Q3USF0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
B3gnt6Q3USF0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
B3gnt6Q3USF0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
B3gnt6Q3USF0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
B3gnt6Q3USF0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
B3gnt6Q3USF0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
B3gnt6Q3USF0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
B3gnt6Q3USF0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
B3gnt6Q3USF0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
B3gnt6Q3USF0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
B3gnt6Q3USF0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
B3gnt6Q3USF0 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
B3gnt6Q3USF0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
B3gnt6Q3USF0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
B3gnt6Q3USF0 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
B3gnt6Q3USF0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
B3gnt6Q3USF0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
B3gnt6Q3USF0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
B3gnt6Q3USF0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
B3gnt6Q3USF0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
B3gnt6Q3USF0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
B3gnt6Q3USF0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
B3gnt6Q3USF0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
B3gnt6Q3USF0 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
B3gnt6Q3USF0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
B3gnt6Q3USF0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
B3gnt6Q3USF0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
B3gnt6Q3USF0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
B3gnt6Q3USF0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
B3gnt6Q3USF0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
B3gnt6Q3USF0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
B3gnt6Q3USF0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
B3gnt6Q3USF0 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
B3gnt6Q3USF0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
B3gnt6Q3USF0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
B3gnt6Q3USF0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
B3gnt6Q3USF0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
B3gnt6Q3USF0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
B3gnt6Q3USF0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
B3gnt6Q3USF0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
B3gnt6Q3USF0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
B3gnt6Q3USF0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
B3gnt6Q3USF0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
B3gnt6Q3USF0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
B3gnt6Q3USF0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
B3gnt6Q3USF0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
B3gnt6Q3USF0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
B3gnt6Q3USF0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
B3gnt6Q3USF0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
B3gnt6Q3USF0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
B3gnt6Q3USF0 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
B3gnt6Q3USF0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
B3gnt6Q3USF0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
B3gnt6Q3USF0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
B3gnt6Q3USF0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
B3gnt6Q3USF0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
B3gnt6Q3USF0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
B3gnt6Q3USF0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
B3gnt6Q3USF0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
B3gnt6Q3USF0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
B3gnt6Q3USF0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
B3gnt6Q3USF0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
B3gnt6Q3USF0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
B3gnt6Q3USF0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
B3gnt6Q3USF0 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
B3gnt6Q3USF0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
B3gnt6Q3USF0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
B3gnt6Q3USF0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
B3gnt6Q3USF0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms