Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQU0

Brd9, Bromodomain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd9Q3UQU0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Brd9Q3UQU0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Brd9Q3UQU0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Brd9Q3UQU0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Brd9Q3UQU0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Brd9Q3UQU0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Brd9Q3UQU0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Brd9Q3UQU0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brd9Q3UQU0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brd9Q3UQU0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brd9Q3UQU0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brd9Q3UQU0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brd9Q3UQU0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brd9Q3UQU0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brd9Q3UQU0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brd9Q3UQU0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brd9Q3UQU0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brd9Q3UQU0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Brd9Q3UQU0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Brd9Q3UQU0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Brd9Q3UQU0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Brd9Q3UQU0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Brd9Q3UQU0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Brd9Q3UQU0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Brd9Q3UQU0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Brd9Q3UQU0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Brd9Q3UQU0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Brd9Q3UQU0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brd9Q3UQU0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brd9Q3UQU0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brd9Q3UQU0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Brd9Q3UQU0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Brd9Q3UQU0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Brd9Q3UQU0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Brd9Q3UQU0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Brd9Q3UQU0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Brd9Q3UQU0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Brd9Q3UQU0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Brd9Q3UQU0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Brd9Q3UQU0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Brd9Q3UQU0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Brd9Q3UQU0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Brd9Q3UQU0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Brd9Q3UQU0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Brd9Q3UQU0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Brd9Q3UQU0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Brd9Q3UQU0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Brd9Q3UQU0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Brd9Q3UQU0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Brd9Q3UQU0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Brd9Q3UQU0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Brd9Q3UQU0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brd9Q3UQU0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brd9Q3UQU0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brd9Q3UQU0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brd9Q3UQU0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brd9Q3UQU0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brd9Q3UQU0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brd9Q3UQU0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brd9Q3UQU0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brd9Q3UQU0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brd9Q3UQU0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brd9Q3UQU0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brd9Q3UQU0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Brd9Q3UQU0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Brd9Q3UQU0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Brd9Q3UQU0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Brd9Q3UQU0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Brd9Q3UQU0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Brd9Q3UQU0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Brd9Q3UQU0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Brd9Q3UQU0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Brd9Q3UQU0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Brd9Q3UQU0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Brd9Q3UQU0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Brd9Q3UQU0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Brd9Q3UQU0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Brd9Q3UQU0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Brd9Q3UQU0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Brd9Q3UQU0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Brd9Q3UQU0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Brd9Q3UQU0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Brd9Q3UQU0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Brd9Q3UQU0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Brd9Q3UQU0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Brd9Q3UQU0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Brd9Q3UQU0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Brd9Q3UQU0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Brd9Q3UQU0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Brd9Q3UQU0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Brd9Q3UQU0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Brd9Q3UQU0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Brd9Q3UQU0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Brd9Q3UQU0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Brd9Q3UQU0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Brd9Q3UQU0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Brd9Q3UQU0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Brd9Q3UQU0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Brd9Q3UQU0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Brd9Q3UQU0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms