Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPC7

Uncharacterized protein KIAA0825 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UPC7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Q3UPC7 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Q3UPC7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Q3UPC7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Q3UPC7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Q3UPC7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Q3UPC7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Q3UPC7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Q3UPC7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Q3UPC7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Q3UPC7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Q3UPC7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Q3UPC7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Q3UPC7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Q3UPC7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Q3UPC7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Q3UPC7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Q3UPC7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Q3UPC7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Q3UPC7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Q3UPC7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Q3UPC7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Q3UPC7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Q3UPC7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Q3UPC7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Q3UPC7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Q3UPC7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Q3UPC7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Q3UPC7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Q3UPC7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Q3UPC7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Q3UPC7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Q3UPC7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Q3UPC7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Q3UPC7 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Q3UPC7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Q3UPC7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Q3UPC7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Q3UPC7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Q3UPC7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Q3UPC7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Q3UPC7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Q3UPC7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Q3UPC7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Q3UPC7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Q3UPC7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Q3UPC7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Q3UPC7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Q3UPC7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Q3UPC7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Q3UPC7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Q3UPC7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Q3UPC7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Q3UPC7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Q3UPC7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Q3UPC7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Q3UPC7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Q3UPC7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Q3UPC7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Q3UPC7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Q3UPC7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Q3UPC7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Q3UPC7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Q3UPC7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Q3UPC7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Q3UPC7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Q3UPC7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Q3UPC7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Q3UPC7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Q3UPC7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Q3UPC7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Q3UPC7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Q3UPC7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Q3UPC7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Q3UPC7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Q3UPC7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Q3UPC7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Q3UPC7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Q3UPC7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Q3UPC7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Q3UPC7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Q3UPC7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Q3UPC7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Q3UPC7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Q3UPC7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Q3UPC7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Q3UPC7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Q3UPC7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Q3UPC7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Q3UPC7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Q3UPC7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Q3UPC7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Q3UPC7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Q3UPC7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Q3UPC7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Q3UPC7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Q3UPC7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Q3UPC7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Q3UPC7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Q3UPC7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms