Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cog7Q3UM29 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cog7Q3UM29 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Cog7Q3UM29 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cog7Q3UM29 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cog7Q3UM29 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cog7Q3UM29 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cog7Q3UM29 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cog7Q3UM29 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cog7Q3UM29 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cog7Q3UM29 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cog7Q3UM29 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cog7Q3UM29 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Cog7Q3UM29 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cog7Q3UM29 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cog7Q3UM29 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cog7Q3UM29 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cog7Q3UM29 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cog7Q3UM29 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cog7Q3UM29 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Cog7Q3UM29 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cog7Q3UM29 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cog7Q3UM29 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cog7Q3UM29 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cog7Q3UM29 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cog7Q3UM29 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cog7Q3UM29 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cog7Q3UM29 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cog7Q3UM29 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cog7Q3UM29 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cog7Q3UM29 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cog7Q3UM29 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cog7Q3UM29 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cog7Q3UM29 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cog7Q3UM29 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cog7Q3UM29 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cog7Q3UM29 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cog7Q3UM29 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cog7Q3UM29 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cog7Q3UM29 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cog7Q3UM29 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cog7Q3UM29 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cog7Q3UM29 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cog7Q3UM29 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cog7Q3UM29 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cog7Q3UM29 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cog7Q3UM29 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cog7Q3UM29 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cog7Q3UM29 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cog7Q3UM29 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cog7Q3UM29 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cog7Q3UM29 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cog7Q3UM29 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cog7Q3UM29 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cog7Q3UM29 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Cog7Q3UM29 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cog7Q3UM29 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cog7Q3UM29 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cog7Q3UM29 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Cog7Q3UM29 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cog7Q3UM29 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cog7Q3UM29 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cog7Q3UM29 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cog7Q3UM29 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cog7Q3UM29 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cog7Q3UM29 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cog7Q3UM29 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cog7Q3UM29 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Cog7Q3UM29 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cog7Q3UM29 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cog7Q3UM29 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cog7Q3UM29 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cog7Q3UM29 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cog7Q3UM29 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cog7Q3UM29 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cog7Q3UM29 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cog7Q3UM29 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cog7Q3UM29 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cog7Q3UM29 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cog7Q3UM29 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cog7Q3UM29 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cog7Q3UM29 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cog7Q3UM29 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cog7Q3UM29 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cog7Q3UM29 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cog7Q3UM29 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Cog7Q3UM29 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cog7Q3UM29 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cog7Q3UM29 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cog7Q3UM29 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cog7Q3UM29 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cog7Q3UM29 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cog7Q3UM29 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cog7Q3UM29 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cog7Q3UM29 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cog7Q3UM29 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cog7Q3UM29 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cog7Q3UM29 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cog7Q3UM29 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cog7Q3UM29 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms