Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHF3

Mier3, Mesoderm induction early response protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mier3Q3UHF3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mier3Q3UHF3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mier3Q3UHF3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mier3Q3UHF3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mier3Q3UHF3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mier3Q3UHF3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mier3Q3UHF3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mier3Q3UHF3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mier3Q3UHF3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mier3Q3UHF3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mier3Q3UHF3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mier3Q3UHF3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mier3Q3UHF3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mier3Q3UHF3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mier3Q3UHF3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mier3Q3UHF3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mier3Q3UHF3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mier3Q3UHF3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mier3Q3UHF3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mier3Q3UHF3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mier3Q3UHF3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mier3Q3UHF3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mier3Q3UHF3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mier3Q3UHF3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mier3Q3UHF3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mier3Q3UHF3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mier3Q3UHF3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mier3Q3UHF3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mier3Q3UHF3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mier3Q3UHF3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mier3Q3UHF3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mier3Q3UHF3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Mier3Q3UHF3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mier3Q3UHF3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mier3Q3UHF3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mier3Q3UHF3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mier3Q3UHF3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mier3Q3UHF3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mier3Q3UHF3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mier3Q3UHF3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mier3Q3UHF3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mier3Q3UHF3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mier3Q3UHF3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mier3Q3UHF3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mier3Q3UHF3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mier3Q3UHF3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Mier3Q3UHF3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mier3Q3UHF3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mier3Q3UHF3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mier3Q3UHF3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Mier3Q3UHF3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mier3Q3UHF3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mier3Q3UHF3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mier3Q3UHF3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Mier3Q3UHF3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mier3Q3UHF3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mier3Q3UHF3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mier3Q3UHF3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Mier3Q3UHF3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mier3Q3UHF3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mier3Q3UHF3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mier3Q3UHF3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mier3Q3UHF3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mier3Q3UHF3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mier3Q3UHF3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mier3Q3UHF3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mier3Q3UHF3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mier3Q3UHF3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mier3Q3UHF3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mier3Q3UHF3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mier3Q3UHF3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mier3Q3UHF3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mier3Q3UHF3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mier3Q3UHF3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mier3Q3UHF3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mier3Q3UHF3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mier3Q3UHF3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mier3Q3UHF3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mier3Q3UHF3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mier3Q3UHF3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mier3Q3UHF3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mier3Q3UHF3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mier3Q3UHF3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mier3Q3UHF3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mier3Q3UHF3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mier3Q3UHF3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mier3Q3UHF3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mier3Q3UHF3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Mier3Q3UHF3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mier3Q3UHF3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mier3Q3UHF3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mier3Q3UHF3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mier3Q3UHF3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Mier3Q3UHF3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mier3Q3UHF3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mier3Q3UHF3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mier3Q3UHF3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mier3Q3UHF3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mier3Q3UHF3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mier3Q3UHF3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms