Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0V1

Khsrp, Far upstream element-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KhsrpQ3U0V1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KhsrpQ3U0V1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KhsrpQ3U0V1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KhsrpQ3U0V1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KhsrpQ3U0V1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KhsrpQ3U0V1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KhsrpQ3U0V1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KhsrpQ3U0V1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KhsrpQ3U0V1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KhsrpQ3U0V1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KhsrpQ3U0V1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KhsrpQ3U0V1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KhsrpQ3U0V1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KhsrpQ3U0V1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KhsrpQ3U0V1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KhsrpQ3U0V1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KhsrpQ3U0V1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KhsrpQ3U0V1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KhsrpQ3U0V1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KhsrpQ3U0V1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KhsrpQ3U0V1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KhsrpQ3U0V1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KhsrpQ3U0V1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KhsrpQ3U0V1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KhsrpQ3U0V1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KhsrpQ3U0V1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KhsrpQ3U0V1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KhsrpQ3U0V1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KhsrpQ3U0V1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KhsrpQ3U0V1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KhsrpQ3U0V1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KhsrpQ3U0V1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KhsrpQ3U0V1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KhsrpQ3U0V1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KhsrpQ3U0V1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KhsrpQ3U0V1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KhsrpQ3U0V1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KhsrpQ3U0V1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KhsrpQ3U0V1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KhsrpQ3U0V1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KhsrpQ3U0V1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KhsrpQ3U0V1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KhsrpQ3U0V1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KhsrpQ3U0V1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KhsrpQ3U0V1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KhsrpQ3U0V1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KhsrpQ3U0V1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KhsrpQ3U0V1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KhsrpQ3U0V1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KhsrpQ3U0V1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KhsrpQ3U0V1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KhsrpQ3U0V1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KhsrpQ3U0V1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KhsrpQ3U0V1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KhsrpQ3U0V1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KhsrpQ3U0V1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KhsrpQ3U0V1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KhsrpQ3U0V1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
KhsrpQ3U0V1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KhsrpQ3U0V1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KhsrpQ3U0V1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KhsrpQ3U0V1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KhsrpQ3U0V1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KhsrpQ3U0V1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KhsrpQ3U0V1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KhsrpQ3U0V1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KhsrpQ3U0V1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KhsrpQ3U0V1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KhsrpQ3U0V1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KhsrpQ3U0V1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KhsrpQ3U0V1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KhsrpQ3U0V1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KhsrpQ3U0V1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KhsrpQ3U0V1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KhsrpQ3U0V1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KhsrpQ3U0V1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KhsrpQ3U0V1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KhsrpQ3U0V1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KhsrpQ3U0V1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KhsrpQ3U0V1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KhsrpQ3U0V1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KhsrpQ3U0V1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KhsrpQ3U0V1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KhsrpQ3U0V1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KhsrpQ3U0V1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KhsrpQ3U0V1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KhsrpQ3U0V1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KhsrpQ3U0V1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KhsrpQ3U0V1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KhsrpQ3U0V1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KhsrpQ3U0V1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KhsrpQ3U0V1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KhsrpQ3U0V1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KhsrpQ3U0V1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KhsrpQ3U0V1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
KhsrpQ3U0V1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
KhsrpQ3U0V1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KhsrpQ3U0V1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KhsrpQ3U0V1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KhsrpQ3U0V1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms