Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYD6

Lmtk2, Serine/threonine-protein kinase LMTK2, mousemouse

Predictions only

Length 1,471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmtk2Q3TYD6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Lmtk2Q3TYD6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Lmtk2Q3TYD6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Lmtk2Q3TYD6 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Lmtk2Q3TYD6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Lmtk2Q3TYD6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Lmtk2Q3TYD6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Lmtk2Q3TYD6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Lmtk2Q3TYD6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Lmtk2Q3TYD6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Lmtk2Q3TYD6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Lmtk2Q3TYD6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Lmtk2Q3TYD6 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Lmtk2Q3TYD6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Lmtk2Q3TYD6 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Lmtk2Q3TYD6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Lmtk2Q3TYD6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Lmtk2Q3TYD6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Lmtk2Q3TYD6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Lmtk2Q3TYD6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Lmtk2Q3TYD6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Lmtk2Q3TYD6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
Lmtk2Q3TYD6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
Lmtk2Q3TYD6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Lmtk2Q3TYD6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Lmtk2Q3TYD6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Lmtk2Q3TYD6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Lmtk2Q3TYD6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Lmtk2Q3TYD6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Lmtk2Q3TYD6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Lmtk2Q3TYD6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Lmtk2Q3TYD6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Lmtk2Q3TYD6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Lmtk2Q3TYD6 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Lmtk2Q3TYD6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Lmtk2Q3TYD6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Lmtk2Q3TYD6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Lmtk2Q3TYD6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Lmtk2Q3TYD6 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Lmtk2Q3TYD6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Lmtk2Q3TYD6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Lmtk2Q3TYD6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Lmtk2Q3TYD6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Lmtk2Q3TYD6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Lmtk2Q3TYD6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Lmtk2Q3TYD6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Lmtk2Q3TYD6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Lmtk2Q3TYD6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Lmtk2Q3TYD6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Lmtk2Q3TYD6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Lmtk2Q3TYD6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Lmtk2Q3TYD6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Lmtk2Q3TYD6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Lmtk2Q3TYD6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Lmtk2Q3TYD6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Lmtk2Q3TYD6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Lmtk2Q3TYD6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Lmtk2Q3TYD6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Lmtk2Q3TYD6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Lmtk2Q3TYD6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Lmtk2Q3TYD6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Lmtk2Q3TYD6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Lmtk2Q3TYD6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Lmtk2Q3TYD6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Lmtk2Q3TYD6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Lmtk2Q3TYD6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Lmtk2Q3TYD6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Lmtk2Q3TYD6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Lmtk2Q3TYD6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Lmtk2Q3TYD6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Lmtk2Q3TYD6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Lmtk2Q3TYD6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Lmtk2Q3TYD6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Lmtk2Q3TYD6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Lmtk2Q3TYD6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Lmtk2Q3TYD6 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Lmtk2Q3TYD6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Lmtk2Q3TYD6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Lmtk2Q3TYD6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Lmtk2Q3TYD6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Lmtk2Q3TYD6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Lmtk2Q3TYD6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Lmtk2Q3TYD6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Lmtk2Q3TYD6 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Lmtk2Q3TYD6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Lmtk2Q3TYD6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
Lmtk2Q3TYD6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Lmtk2Q3TYD6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Lmtk2Q3TYD6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Lmtk2Q3TYD6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Lmtk2Q3TYD6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Lmtk2Q3TYD6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Lmtk2Q3TYD6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Lmtk2Q3TYD6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Lmtk2Q3TYD6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Lmtk2Q3TYD6 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Lmtk2Q3TYD6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Lmtk2Q3TYD6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Lmtk2Q3TYD6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Lmtk2Q3TYD6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms