Protein–RNA interactions for Protein: Q3TB48

Tmem104, Transmembrane protein 104, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem104Q3TB48 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmem104Q3TB48 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmem104Q3TB48 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmem104Q3TB48 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmem104Q3TB48 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmem104Q3TB48 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmem104Q3TB48 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmem104Q3TB48 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmem104Q3TB48 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmem104Q3TB48 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmem104Q3TB48 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmem104Q3TB48 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmem104Q3TB48 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Tmem104Q3TB48 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Tmem104Q3TB48 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmem104Q3TB48 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmem104Q3TB48 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmem104Q3TB48 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmem104Q3TB48 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmem104Q3TB48 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmem104Q3TB48 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmem104Q3TB48 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmem104Q3TB48 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmem104Q3TB48 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmem104Q3TB48 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmem104Q3TB48 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmem104Q3TB48 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmem104Q3TB48 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmem104Q3TB48 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmem104Q3TB48 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmem104Q3TB48 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmem104Q3TB48 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmem104Q3TB48 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmem104Q3TB48 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmem104Q3TB48 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmem104Q3TB48 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmem104Q3TB48 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmem104Q3TB48 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmem104Q3TB48 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmem104Q3TB48 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmem104Q3TB48 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmem104Q3TB48 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmem104Q3TB48 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmem104Q3TB48 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmem104Q3TB48 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmem104Q3TB48 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmem104Q3TB48 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmem104Q3TB48 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmem104Q3TB48 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmem104Q3TB48 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmem104Q3TB48 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmem104Q3TB48 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmem104Q3TB48 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmem104Q3TB48 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmem104Q3TB48 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem104Q3TB48 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem104Q3TB48 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem104Q3TB48 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem104Q3TB48 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem104Q3TB48 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem104Q3TB48 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem104Q3TB48 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem104Q3TB48 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem104Q3TB48 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem104Q3TB48 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem104Q3TB48 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem104Q3TB48 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem104Q3TB48 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem104Q3TB48 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem104Q3TB48 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem104Q3TB48 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem104Q3TB48 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem104Q3TB48 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem104Q3TB48 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem104Q3TB48 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem104Q3TB48 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem104Q3TB48 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem104Q3TB48 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem104Q3TB48 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem104Q3TB48 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem104Q3TB48 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem104Q3TB48 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem104Q3TB48 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem104Q3TB48 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem104Q3TB48 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem104Q3TB48 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem104Q3TB48 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem104Q3TB48 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmem104Q3TB48 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmem104Q3TB48 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem104Q3TB48 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem104Q3TB48 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem104Q3TB48 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem104Q3TB48 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem104Q3TB48 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem104Q3TB48 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem104Q3TB48 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem104Q3TB48 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem104Q3TB48 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem104Q3TB48 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms