Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hddc2Q3SXD3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hddc2Q3SXD3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hddc2Q3SXD3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hddc2Q3SXD3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hddc2Q3SXD3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hddc2Q3SXD3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hddc2Q3SXD3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hddc2Q3SXD3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hddc2Q3SXD3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hddc2Q3SXD3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hddc2Q3SXD3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hddc2Q3SXD3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hddc2Q3SXD3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hddc2Q3SXD3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hddc2Q3SXD3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hddc2Q3SXD3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hddc2Q3SXD3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hddc2Q3SXD3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hddc2Q3SXD3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hddc2Q3SXD3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hddc2Q3SXD3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hddc2Q3SXD3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hddc2Q3SXD3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hddc2Q3SXD3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Hddc2Q3SXD3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hddc2Q3SXD3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Hddc2Q3SXD3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hddc2Q3SXD3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hddc2Q3SXD3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hddc2Q3SXD3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hddc2Q3SXD3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hddc2Q3SXD3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hddc2Q3SXD3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hddc2Q3SXD3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Hddc2Q3SXD3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hddc2Q3SXD3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hddc2Q3SXD3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hddc2Q3SXD3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hddc2Q3SXD3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hddc2Q3SXD3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hddc2Q3SXD3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hddc2Q3SXD3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hddc2Q3SXD3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hddc2Q3SXD3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Hddc2Q3SXD3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Hddc2Q3SXD3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Hddc2Q3SXD3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hddc2Q3SXD3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Hddc2Q3SXD3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hddc2Q3SXD3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hddc2Q3SXD3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hddc2Q3SXD3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Hddc2Q3SXD3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hddc2Q3SXD3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hddc2Q3SXD3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hddc2Q3SXD3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hddc2Q3SXD3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hddc2Q3SXD3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Hddc2Q3SXD3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hddc2Q3SXD3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hddc2Q3SXD3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hddc2Q3SXD3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hddc2Q3SXD3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hddc2Q3SXD3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hddc2Q3SXD3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hddc2Q3SXD3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hddc2Q3SXD3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hddc2Q3SXD3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hddc2Q3SXD3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hddc2Q3SXD3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hddc2Q3SXD3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hddc2Q3SXD3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hddc2Q3SXD3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hddc2Q3SXD3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hddc2Q3SXD3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hddc2Q3SXD3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hddc2Q3SXD3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hddc2Q3SXD3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hddc2Q3SXD3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hddc2Q3SXD3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hddc2Q3SXD3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hddc2Q3SXD3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hddc2Q3SXD3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Hddc2Q3SXD3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hddc2Q3SXD3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hddc2Q3SXD3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hddc2Q3SXD3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hddc2Q3SXD3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hddc2Q3SXD3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hddc2Q3SXD3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hddc2Q3SXD3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hddc2Q3SXD3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hddc2Q3SXD3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hddc2Q3SXD3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hddc2Q3SXD3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hddc2Q3SXD3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hddc2Q3SXD3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hddc2Q3SXD3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hddc2Q3SXD3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms