Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cpne9Q1RLL3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Cpne9Q1RLL3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cpne9Q1RLL3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cpne9Q1RLL3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cpne9Q1RLL3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cpne9Q1RLL3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cpne9Q1RLL3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cpne9Q1RLL3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cpne9Q1RLL3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cpne9Q1RLL3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cpne9Q1RLL3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cpne9Q1RLL3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cpne9Q1RLL3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cpne9Q1RLL3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cpne9Q1RLL3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cpne9Q1RLL3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cpne9Q1RLL3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cpne9Q1RLL3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cpne9Q1RLL3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cpne9Q1RLL3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cpne9Q1RLL3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cpne9Q1RLL3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cpne9Q1RLL3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cpne9Q1RLL3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cpne9Q1RLL3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cpne9Q1RLL3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cpne9Q1RLL3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cpne9Q1RLL3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cpne9Q1RLL3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cpne9Q1RLL3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cpne9Q1RLL3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cpne9Q1RLL3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cpne9Q1RLL3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cpne9Q1RLL3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cpne9Q1RLL3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cpne9Q1RLL3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cpne9Q1RLL3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cpne9Q1RLL3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cpne9Q1RLL3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cpne9Q1RLL3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cpne9Q1RLL3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cpne9Q1RLL3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cpne9Q1RLL3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cpne9Q1RLL3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cpne9Q1RLL3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cpne9Q1RLL3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cpne9Q1RLL3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cpne9Q1RLL3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cpne9Q1RLL3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Cpne9Q1RLL3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cpne9Q1RLL3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cpne9Q1RLL3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cpne9Q1RLL3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cpne9Q1RLL3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Cpne9Q1RLL3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cpne9Q1RLL3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cpne9Q1RLL3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cpne9Q1RLL3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cpne9Q1RLL3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cpne9Q1RLL3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Cpne9Q1RLL3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cpne9Q1RLL3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cpne9Q1RLL3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cpne9Q1RLL3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cpne9Q1RLL3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cpne9Q1RLL3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cpne9Q1RLL3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cpne9Q1RLL3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Cpne9Q1RLL3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cpne9Q1RLL3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cpne9Q1RLL3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cpne9Q1RLL3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cpne9Q1RLL3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cpne9Q1RLL3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Cpne9Q1RLL3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cpne9Q1RLL3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cpne9Q1RLL3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cpne9Q1RLL3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cpne9Q1RLL3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cpne9Q1RLL3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cpne9Q1RLL3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cpne9Q1RLL3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cpne9Q1RLL3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cpne9Q1RLL3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cpne9Q1RLL3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cpne9Q1RLL3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cpne9Q1RLL3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cpne9Q1RLL3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cpne9Q1RLL3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cpne9Q1RLL3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cpne9Q1RLL3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cpne9Q1RLL3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cpne9Q1RLL3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cpne9Q1RLL3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cpne9Q1RLL3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cpne9Q1RLL3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cpne9Q1RLL3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cpne9Q1RLL3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cpne9Q1RLL3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
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