Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spatc1Q148B6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spatc1Q148B6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spatc1Q148B6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spatc1Q148B6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spatc1Q148B6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spatc1Q148B6 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spatc1Q148B6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spatc1Q148B6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spatc1Q148B6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spatc1Q148B6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spatc1Q148B6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Spatc1Q148B6 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spatc1Q148B6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spatc1Q148B6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spatc1Q148B6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spatc1Q148B6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spatc1Q148B6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Spatc1Q148B6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spatc1Q148B6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spatc1Q148B6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spatc1Q148B6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spatc1Q148B6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spatc1Q148B6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spatc1Q148B6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spatc1Q148B6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spatc1Q148B6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spatc1Q148B6 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spatc1Q148B6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spatc1Q148B6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spatc1Q148B6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spatc1Q148B6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spatc1Q148B6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spatc1Q148B6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spatc1Q148B6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spatc1Q148B6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spatc1Q148B6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Spatc1Q148B6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spatc1Q148B6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spatc1Q148B6 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spatc1Q148B6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spatc1Q148B6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spatc1Q148B6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spatc1Q148B6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spatc1Q148B6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Spatc1Q148B6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spatc1Q148B6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spatc1Q148B6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spatc1Q148B6 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spatc1Q148B6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spatc1Q148B6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spatc1Q148B6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spatc1Q148B6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spatc1Q148B6 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spatc1Q148B6 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spatc1Q148B6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spatc1Q148B6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spatc1Q148B6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spatc1Q148B6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spatc1Q148B6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spatc1Q148B6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spatc1Q148B6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spatc1Q148B6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spatc1Q148B6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spatc1Q148B6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spatc1Q148B6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spatc1Q148B6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spatc1Q148B6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spatc1Q148B6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spatc1Q148B6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spatc1Q148B6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spatc1Q148B6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spatc1Q148B6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spatc1Q148B6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spatc1Q148B6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spatc1Q148B6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spatc1Q148B6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spatc1Q148B6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spatc1Q148B6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spatc1Q148B6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spatc1Q148B6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spatc1Q148B6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spatc1Q148B6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spatc1Q148B6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spatc1Q148B6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spatc1Q148B6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spatc1Q148B6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spatc1Q148B6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spatc1Q148B6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spatc1Q148B6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spatc1Q148B6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spatc1Q148B6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spatc1Q148B6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spatc1Q148B6 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spatc1Q148B6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Spatc1Q148B6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Spatc1Q148B6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Spatc1Q148B6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spatc1Q148B6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spatc1Q148B6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms