Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Vps8Q0P5W1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Vps8Q0P5W1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Vps8Q0P5W1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Vps8Q0P5W1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Vps8Q0P5W1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Vps8Q0P5W1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Vps8Q0P5W1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Vps8Q0P5W1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Vps8Q0P5W1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Vps8Q0P5W1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Vps8Q0P5W1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Vps8Q0P5W1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Vps8Q0P5W1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Vps8Q0P5W1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Vps8Q0P5W1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Vps8Q0P5W1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Vps8Q0P5W1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Vps8Q0P5W1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Vps8Q0P5W1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Vps8Q0P5W1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Vps8Q0P5W1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Vps8Q0P5W1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Vps8Q0P5W1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Vps8Q0P5W1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Vps8Q0P5W1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Vps8Q0P5W1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Vps8Q0P5W1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Vps8Q0P5W1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Vps8Q0P5W1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Vps8Q0P5W1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Vps8Q0P5W1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Vps8Q0P5W1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Vps8Q0P5W1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Vps8Q0P5W1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Vps8Q0P5W1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Vps8Q0P5W1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Vps8Q0P5W1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Vps8Q0P5W1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Vps8Q0P5W1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Vps8Q0P5W1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Vps8Q0P5W1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Vps8Q0P5W1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Vps8Q0P5W1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Vps8Q0P5W1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Vps8Q0P5W1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Vps8Q0P5W1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Vps8Q0P5W1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Vps8Q0P5W1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Vps8Q0P5W1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Vps8Q0P5W1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Vps8Q0P5W1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Vps8Q0P5W1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Vps8Q0P5W1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Vps8Q0P5W1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Vps8Q0P5W1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
Vps8Q0P5W1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Vps8Q0P5W1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Vps8Q0P5W1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Vps8Q0P5W1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Vps8Q0P5W1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Vps8Q0P5W1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Vps8Q0P5W1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Vps8Q0P5W1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Vps8Q0P5W1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Vps8Q0P5W1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Vps8Q0P5W1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Vps8Q0P5W1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Vps8Q0P5W1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Vps8Q0P5W1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Vps8Q0P5W1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Vps8Q0P5W1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Vps8Q0P5W1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Vps8Q0P5W1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Vps8Q0P5W1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Vps8Q0P5W1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Vps8Q0P5W1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Vps8Q0P5W1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Vps8Q0P5W1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Vps8Q0P5W1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Vps8Q0P5W1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Vps8Q0P5W1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Vps8Q0P5W1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Vps8Q0P5W1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Vps8Q0P5W1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Vps8Q0P5W1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Vps8Q0P5W1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Vps8Q0P5W1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Vps8Q0P5W1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Vps8Q0P5W1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Vps8Q0P5W1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Vps8Q0P5W1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Vps8Q0P5W1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Vps8Q0P5W1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Vps8Q0P5W1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Vps8Q0P5W1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Vps8Q0P5W1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Vps8Q0P5W1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Vps8Q0P5W1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Vps8Q0P5W1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms