Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
1700061G19RikQ08EE8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
1700061G19RikQ08EE8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
1700061G19RikQ08EE8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
1700061G19RikQ08EE8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
1700061G19RikQ08EE8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
1700061G19RikQ08EE8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
1700061G19RikQ08EE8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
1700061G19RikQ08EE8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
1700061G19RikQ08EE8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
1700061G19RikQ08EE8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
1700061G19RikQ08EE8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
1700061G19RikQ08EE8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
1700061G19RikQ08EE8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
1700061G19RikQ08EE8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
1700061G19RikQ08EE8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
1700061G19RikQ08EE8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
1700061G19RikQ08EE8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
1700061G19RikQ08EE8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
1700061G19RikQ08EE8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
1700061G19RikQ08EE8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
1700061G19RikQ08EE8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
1700061G19RikQ08EE8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
1700061G19RikQ08EE8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
1700061G19RikQ08EE8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
1700061G19RikQ08EE8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
1700061G19RikQ08EE8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
1700061G19RikQ08EE8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
1700061G19RikQ08EE8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
1700061G19RikQ08EE8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
1700061G19RikQ08EE8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
1700061G19RikQ08EE8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
1700061G19RikQ08EE8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
1700061G19RikQ08EE8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
1700061G19RikQ08EE8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
1700061G19RikQ08EE8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
1700061G19RikQ08EE8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
1700061G19RikQ08EE8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
1700061G19RikQ08EE8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
1700061G19RikQ08EE8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
1700061G19RikQ08EE8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
1700061G19RikQ08EE8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
1700061G19RikQ08EE8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
1700061G19RikQ08EE8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
1700061G19RikQ08EE8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
1700061G19RikQ08EE8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
1700061G19RikQ08EE8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
1700061G19RikQ08EE8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
1700061G19RikQ08EE8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
1700061G19RikQ08EE8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
1700061G19RikQ08EE8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
1700061G19RikQ08EE8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
1700061G19RikQ08EE8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
1700061G19RikQ08EE8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
1700061G19RikQ08EE8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
1700061G19RikQ08EE8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
1700061G19RikQ08EE8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
1700061G19RikQ08EE8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
1700061G19RikQ08EE8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
1700061G19RikQ08EE8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
1700061G19RikQ08EE8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
1700061G19RikQ08EE8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
1700061G19RikQ08EE8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
1700061G19RikQ08EE8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
1700061G19RikQ08EE8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
1700061G19RikQ08EE8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
1700061G19RikQ08EE8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
1700061G19RikQ08EE8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
1700061G19RikQ08EE8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
1700061G19RikQ08EE8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
1700061G19RikQ08EE8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
1700061G19RikQ08EE8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
1700061G19RikQ08EE8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
1700061G19RikQ08EE8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
1700061G19RikQ08EE8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
1700061G19RikQ08EE8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
1700061G19RikQ08EE8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
1700061G19RikQ08EE8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
1700061G19RikQ08EE8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
1700061G19RikQ08EE8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
1700061G19RikQ08EE8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
1700061G19RikQ08EE8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700061G19RikQ08EE8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700061G19RikQ08EE8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700061G19RikQ08EE8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700061G19RikQ08EE8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700061G19RikQ08EE8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700061G19RikQ08EE8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700061G19RikQ08EE8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700061G19RikQ08EE8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700061G19RikQ08EE8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700061G19RikQ08EE8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700061G19RikQ08EE8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700061G19RikQ08EE8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700061G19RikQ08EE8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700061G19RikQ08EE8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700061G19RikQ08EE8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700061G19RikQ08EE8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700061G19RikQ08EE8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
1700061G19RikQ08EE8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms