Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tgm3Q08189 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tgm3Q08189 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tgm3Q08189 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tgm3Q08189 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Tgm3Q08189 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tgm3Q08189 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tgm3Q08189 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tgm3Q08189 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tgm3Q08189 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tgm3Q08189 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tgm3Q08189 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tgm3Q08189 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tgm3Q08189 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Tgm3Q08189 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Tgm3Q08189 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tgm3Q08189 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tgm3Q08189 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tgm3Q08189 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Tgm3Q08189 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tgm3Q08189 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tgm3Q08189 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tgm3Q08189 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tgm3Q08189 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tgm3Q08189 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tgm3Q08189 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tgm3Q08189 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tgm3Q08189 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tgm3Q08189 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tgm3Q08189 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tgm3Q08189 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tgm3Q08189 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tgm3Q08189 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tgm3Q08189 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tgm3Q08189 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tgm3Q08189 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tgm3Q08189 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tgm3Q08189 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tgm3Q08189 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tgm3Q08189 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tgm3Q08189 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tgm3Q08189 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Tgm3Q08189 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tgm3Q08189 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tgm3Q08189 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tgm3Q08189 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tgm3Q08189 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tgm3Q08189 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tgm3Q08189 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tgm3Q08189 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tgm3Q08189 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tgm3Q08189 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tgm3Q08189 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tgm3Q08189 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Tgm3Q08189 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tgm3Q08189 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tgm3Q08189 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tgm3Q08189 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tgm3Q08189 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tgm3Q08189 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tgm3Q08189 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tgm3Q08189 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Tgm3Q08189 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tgm3Q08189 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tgm3Q08189 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tgm3Q08189 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tgm3Q08189 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tgm3Q08189 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tgm3Q08189 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tgm3Q08189 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tgm3Q08189 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tgm3Q08189 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tgm3Q08189 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tgm3Q08189 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tgm3Q08189 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tgm3Q08189 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tgm3Q08189 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tgm3Q08189 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tgm3Q08189 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tgm3Q08189 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tgm3Q08189 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tgm3Q08189 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tgm3Q08189 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tgm3Q08189 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tgm3Q08189 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tgm3Q08189 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tgm3Q08189 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Tgm3Q08189 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tgm3Q08189 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Tgm3Q08189 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tgm3Q08189 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tgm3Q08189 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tgm3Q08189 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tgm3Q08189 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tgm3Q08189 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tgm3Q08189 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tgm3Q08189 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tgm3Q08189 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tgm3Q08189 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tgm3Q08189 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms