Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sox8Q04886 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sox8Q04886 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sox8Q04886 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sox8Q04886 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Sox8Q04886 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sox8Q04886 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sox8Q04886 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sox8Q04886 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sox8Q04886 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sox8Q04886 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sox8Q04886 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sox8Q04886 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sox8Q04886 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sox8Q04886 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sox8Q04886 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sox8Q04886 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sox8Q04886 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sox8Q04886 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sox8Q04886 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sox8Q04886 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Sox8Q04886 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sox8Q04886 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sox8Q04886 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sox8Q04886 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sox8Q04886 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sox8Q04886 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sox8Q04886 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sox8Q04886 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sox8Q04886 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sox8Q04886 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sox8Q04886 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sox8Q04886 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sox8Q04886 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sox8Q04886 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sox8Q04886 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sox8Q04886 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sox8Q04886 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sox8Q04886 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sox8Q04886 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sox8Q04886 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sox8Q04886 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sox8Q04886 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sox8Q04886 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Sox8Q04886 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sox8Q04886 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sox8Q04886 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sox8Q04886 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sox8Q04886 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sox8Q04886 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sox8Q04886 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sox8Q04886 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sox8Q04886 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sox8Q04886 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sox8Q04886 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sox8Q04886 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sox8Q04886 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sox8Q04886 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sox8Q04886 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sox8Q04886 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sox8Q04886 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sox8Q04886 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sox8Q04886 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sox8Q04886 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sox8Q04886 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sox8Q04886 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Sox8Q04886 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sox8Q04886 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sox8Q04886 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sox8Q04886 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sox8Q04886 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sox8Q04886 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sox8Q04886 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sox8Q04886 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sox8Q04886 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sox8Q04886 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sox8Q04886 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sox8Q04886 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sox8Q04886 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sox8Q04886 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sox8Q04886 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sox8Q04886 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sox8Q04886 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Sox8Q04886 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sox8Q04886 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sox8Q04886 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sox8Q04886 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sox8Q04886 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sox8Q04886 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sox8Q04886 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sox8Q04886 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sox8Q04886 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sox8Q04886 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sox8Q04886 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sox8Q04886 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sox8Q04886 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sox8Q04886 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sox8Q04886 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sox8Q04886 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sox8Q04886 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms