Protein–RNA interactions for Protein: Q03401

Crisp1, Cysteine-rich secretory protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crisp1Q03401 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Crisp1Q03401 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Crisp1Q03401 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Crisp1Q03401 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Crisp1Q03401 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Crisp1Q03401 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Crisp1Q03401 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Crisp1Q03401 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Crisp1Q03401 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Crisp1Q03401 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Crisp1Q03401 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Crisp1Q03401 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Crisp1Q03401 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Crisp1Q03401 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Crisp1Q03401 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Crisp1Q03401 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Crisp1Q03401 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Crisp1Q03401 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Crisp1Q03401 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Crisp1Q03401 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Crisp1Q03401 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Crisp1Q03401 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Crisp1Q03401 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Crisp1Q03401 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Crisp1Q03401 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Crisp1Q03401 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Crisp1Q03401 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Crisp1Q03401 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Crisp1Q03401 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Crisp1Q03401 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Crisp1Q03401 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Crisp1Q03401 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Crisp1Q03401 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Crisp1Q03401 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Crisp1Q03401 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Crisp1Q03401 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Crisp1Q03401 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Crisp1Q03401 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Crisp1Q03401 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Crisp1Q03401 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Crisp1Q03401 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Crisp1Q03401 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Crisp1Q03401 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Crisp1Q03401 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Crisp1Q03401 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Crisp1Q03401 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Crisp1Q03401 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Crisp1Q03401 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Crisp1Q03401 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Crisp1Q03401 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Crisp1Q03401 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Crisp1Q03401 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Crisp1Q03401 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Crisp1Q03401 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Crisp1Q03401 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Crisp1Q03401 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Crisp1Q03401 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Crisp1Q03401 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Crisp1Q03401 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Crisp1Q03401 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Crisp1Q03401 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Crisp1Q03401 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Crisp1Q03401 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Crisp1Q03401 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Crisp1Q03401 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Crisp1Q03401 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Crisp1Q03401 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Crisp1Q03401 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Crisp1Q03401 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Crisp1Q03401 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Crisp1Q03401 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Crisp1Q03401 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Crisp1Q03401 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Crisp1Q03401 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Crisp1Q03401 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Crisp1Q03401 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Crisp1Q03401 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Crisp1Q03401 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Crisp1Q03401 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Crisp1Q03401 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Crisp1Q03401 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Crisp1Q03401 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Crisp1Q03401 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Crisp1Q03401 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Crisp1Q03401 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Crisp1Q03401 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Crisp1Q03401 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Crisp1Q03401 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Crisp1Q03401 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Crisp1Q03401 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Crisp1Q03401 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Crisp1Q03401 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Crisp1Q03401 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Crisp1Q03401 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Crisp1Q03401 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Crisp1Q03401 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Crisp1Q03401 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Crisp1Q03401 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Crisp1Q03401 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Crisp1Q03401 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms