Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ascl1Q02067 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ascl1Q02067 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ascl1Q02067 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ascl1Q02067 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ascl1Q02067 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ascl1Q02067 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ascl1Q02067 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ascl1Q02067 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ascl1Q02067 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ascl1Q02067 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ascl1Q02067 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ascl1Q02067 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ascl1Q02067 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ascl1Q02067 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ascl1Q02067 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ascl1Q02067 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ascl1Q02067 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ascl1Q02067 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ascl1Q02067 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ascl1Q02067 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ascl1Q02067 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ascl1Q02067 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ascl1Q02067 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ascl1Q02067 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ascl1Q02067 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ascl1Q02067 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ascl1Q02067 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ascl1Q02067 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ascl1Q02067 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ascl1Q02067 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ascl1Q02067 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ascl1Q02067 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ascl1Q02067 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ascl1Q02067 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ascl1Q02067 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ascl1Q02067 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ascl1Q02067 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ascl1Q02067 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ascl1Q02067 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ascl1Q02067 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ascl1Q02067 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ascl1Q02067 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ascl1Q02067 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ascl1Q02067 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ascl1Q02067 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ascl1Q02067 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ascl1Q02067 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ascl1Q02067 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ascl1Q02067 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ascl1Q02067 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ascl1Q02067 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ascl1Q02067 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ascl1Q02067 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ascl1Q02067 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ascl1Q02067 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ascl1Q02067 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ascl1Q02067 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ascl1Q02067 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ascl1Q02067 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ascl1Q02067 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ascl1Q02067 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ascl1Q02067 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ascl1Q02067 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ascl1Q02067 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ascl1Q02067 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ascl1Q02067 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ascl1Q02067 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ascl1Q02067 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ascl1Q02067 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ascl1Q02067 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ascl1Q02067 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ascl1Q02067 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ascl1Q02067 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ascl1Q02067 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ascl1Q02067 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ascl1Q02067 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ascl1Q02067 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ascl1Q02067 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ascl1Q02067 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ascl1Q02067 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ascl1Q02067 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ascl1Q02067 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ascl1Q02067 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ascl1Q02067 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ascl1Q02067 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ascl1Q02067 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ascl1Q02067 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ascl1Q02067 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ascl1Q02067 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ascl1Q02067 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ascl1Q02067 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ascl1Q02067 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ascl1Q02067 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ascl1Q02067 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ascl1Q02067 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ascl1Q02067 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ascl1Q02067 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ascl1Q02067 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ascl1Q02067 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms