Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cacna1cQ01815 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cacna1cQ01815 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cacna1cQ01815 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cacna1cQ01815 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cacna1cQ01815 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cacna1cQ01815 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cacna1cQ01815 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cacna1cQ01815 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cacna1cQ01815 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cacna1cQ01815 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cacna1cQ01815 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cacna1cQ01815 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cacna1cQ01815 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cacna1cQ01815 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cacna1cQ01815 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cacna1cQ01815 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Cacna1cQ01815 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cacna1cQ01815 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cacna1cQ01815 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cacna1cQ01815 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cacna1cQ01815 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cacna1cQ01815 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cacna1cQ01815 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cacna1cQ01815 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cacna1cQ01815 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cacna1cQ01815 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cacna1cQ01815 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cacna1cQ01815 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cacna1cQ01815 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cacna1cQ01815 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cacna1cQ01815 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cacna1cQ01815 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cacna1cQ01815 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cacna1cQ01815 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cacna1cQ01815 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cacna1cQ01815 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cacna1cQ01815 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cacna1cQ01815 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cacna1cQ01815 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Cacna1cQ01815 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cacna1cQ01815 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cacna1cQ01815 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cacna1cQ01815 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cacna1cQ01815 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cacna1cQ01815 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cacna1cQ01815 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cacna1cQ01815 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cacna1cQ01815 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Cacna1cQ01815 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cacna1cQ01815 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cacna1cQ01815 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cacna1cQ01815 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cacna1cQ01815 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cacna1cQ01815 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cacna1cQ01815 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cacna1cQ01815 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cacna1cQ01815 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cacna1cQ01815 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cacna1cQ01815 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cacna1cQ01815 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cacna1cQ01815 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cacna1cQ01815 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Cacna1cQ01815 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cacna1cQ01815 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cacna1cQ01815 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cacna1cQ01815 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cacna1cQ01815 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cacna1cQ01815 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cacna1cQ01815 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cacna1cQ01815 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cacna1cQ01815 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cacna1cQ01815 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Cacna1cQ01815 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cacna1cQ01815 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cacna1cQ01815 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cacna1cQ01815 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cacna1cQ01815 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cacna1cQ01815 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cacna1cQ01815 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cacna1cQ01815 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cacna1cQ01815 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cacna1cQ01815 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cacna1cQ01815 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cacna1cQ01815 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cacna1cQ01815 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cacna1cQ01815 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cacna1cQ01815 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cacna1cQ01815 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cacna1cQ01815 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Cacna1cQ01815 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cacna1cQ01815 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cacna1cQ01815 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cacna1cQ01815 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cacna1cQ01815 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cacna1cQ01815 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cacna1cQ01815 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cacna1cQ01815 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cacna1cQ01815 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cacna1cQ01815 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms