Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gbp1Q01514 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gbp1Q01514 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gbp1Q01514 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gbp1Q01514 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gbp1Q01514 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Gbp1Q01514 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gbp1Q01514 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gbp1Q01514 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gbp1Q01514 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gbp1Q01514 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Gbp1Q01514 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gbp1Q01514 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gbp1Q01514 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gbp1Q01514 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gbp1Q01514 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gbp1Q01514 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gbp1Q01514 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gbp1Q01514 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gbp1Q01514 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gbp1Q01514 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gbp1Q01514 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gbp1Q01514 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gbp1Q01514 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gbp1Q01514 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gbp1Q01514 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gbp1Q01514 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gbp1Q01514 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gbp1Q01514 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gbp1Q01514 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gbp1Q01514 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Gbp1Q01514 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gbp1Q01514 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gbp1Q01514 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gbp1Q01514 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gbp1Q01514 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gbp1Q01514 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gbp1Q01514 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gbp1Q01514 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gbp1Q01514 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gbp1Q01514 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gbp1Q01514 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gbp1Q01514 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gbp1Q01514 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gbp1Q01514 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Gbp1Q01514 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gbp1Q01514 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gbp1Q01514 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gbp1Q01514 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gbp1Q01514 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gbp1Q01514 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gbp1Q01514 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gbp1Q01514 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gbp1Q01514 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Gbp1Q01514 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Gbp1Q01514 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gbp1Q01514 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gbp1Q01514 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gbp1Q01514 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gbp1Q01514 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gbp1Q01514 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gbp1Q01514 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gbp1Q01514 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gbp1Q01514 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gbp1Q01514 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Gbp1Q01514 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gbp1Q01514 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gbp1Q01514 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gbp1Q01514 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gbp1Q01514 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gbp1Q01514 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gbp1Q01514 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gbp1Q01514 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gbp1Q01514 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gbp1Q01514 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gbp1Q01514 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gbp1Q01514 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gbp1Q01514 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gbp1Q01514 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Gbp1Q01514 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gbp1Q01514 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gbp1Q01514 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Gbp1Q01514 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gbp1Q01514 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gbp1Q01514 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Gbp1Q01514 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gbp1Q01514 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gbp1Q01514 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gbp1Q01514 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gbp1Q01514 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gbp1Q01514 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gbp1Q01514 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gbp1Q01514 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gbp1Q01514 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Gbp1Q01514 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gbp1Q01514 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gbp1Q01514 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gbp1Q01514 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Gbp1Q01514 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gbp1Q01514 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms