Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scn1bP97952 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scn1bP97952 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scn1bP97952 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scn1bP97952 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Scn1bP97952 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scn1bP97952 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scn1bP97952 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scn1bP97952 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scn1bP97952 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scn1bP97952 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scn1bP97952 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scn1bP97952 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scn1bP97952 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scn1bP97952 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scn1bP97952 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scn1bP97952 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scn1bP97952 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scn1bP97952 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scn1bP97952 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scn1bP97952 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scn1bP97952 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scn1bP97952 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scn1bP97952 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scn1bP97952 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scn1bP97952 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scn1bP97952 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scn1bP97952 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scn1bP97952 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Scn1bP97952 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scn1bP97952 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scn1bP97952 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scn1bP97952 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scn1bP97952 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scn1bP97952 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scn1bP97952 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scn1bP97952 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scn1bP97952 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scn1bP97952 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scn1bP97952 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scn1bP97952 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scn1bP97952 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scn1bP97952 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scn1bP97952 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scn1bP97952 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scn1bP97952 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scn1bP97952 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scn1bP97952 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scn1bP97952 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scn1bP97952 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Scn1bP97952 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scn1bP97952 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scn1bP97952 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scn1bP97952 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scn1bP97952 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scn1bP97952 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scn1bP97952 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scn1bP97952 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scn1bP97952 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scn1bP97952 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scn1bP97952 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scn1bP97952 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scn1bP97952 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scn1bP97952 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scn1bP97952 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scn1bP97952 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scn1bP97952 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scn1bP97952 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scn1bP97952 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scn1bP97952 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scn1bP97952 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scn1bP97952 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scn1bP97952 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scn1bP97952 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scn1bP97952 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scn1bP97952 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scn1bP97952 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scn1bP97952 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scn1bP97952 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scn1bP97952 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scn1bP97952 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scn1bP97952 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scn1bP97952 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scn1bP97952 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scn1bP97952 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scn1bP97952 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scn1bP97952 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scn1bP97952 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scn1bP97952 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scn1bP97952 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scn1bP97952 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Scn1bP97952 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scn1bP97952 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scn1bP97952 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scn1bP97952 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Scn1bP97952 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Scn1bP97952 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scn1bP97952 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scn1bP97952 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scn1bP97952 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms